PRJEB112824:乳腺癌易感基因胚系变异全外显子证据
数据围绕乳腺癌易感基因的胚系变异,基于全外显子证据,可用于研究乳腺癌相关基因的胚系变异分布与特征。源站描述仅说明 BioProject 是围绕单一计划、来自单一机构或联盟的生物学数据集合,并提供指向该项目各类数据的链接入口,未提供样本量、测序平台、具体基因列表或分析结论(来源 NCBI)

基本信息
资源简介
PRJEB112824:乳腺癌易感基因胚系变异全外显子证据
该数据集英文名为 PRJEB112824: Germline Variation Across Breast Cancer Predisposition Genes: Whole-Exome Evidence,在源站 NCBI BioProject 中的标题为“Homo sapiens (ID 1486567) - BioProject - NCBI”,本站将其归类于肿瘤 / 乳腺癌方向,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。从名称与主题标签来看,该数据围绕人类乳腺癌易感基因的胚系变异,并以全外显子证据作为核心数据类型,可用于研究乳腺癌相关基因的胚系变异分布与特征。需要说明的是,源站描述仅对 BioProject 这一记录类型作了一般性说明,即 BioProject 是围绕单一计划、来自单一机构或联盟的生物学数据集合,并为用户提供指向该项目所生成各类数据的统一链接入口,并未提供样本量、测序平台、具体基因列表或分析结论。
【数据集背景】
该数据集属于 NCBI BioProject 体系下的一个项目记录,主题聚焦于人类乳腺癌易感基因的胚系变异,并明确以全外显子证据为支撑。乳腺癌是肿瘤研究中的重要方向,而易感基因的胚系变异与遗传易感性密切相关,因此该项目的定位在于为相关研究提供可追溯的数据入口。源站描述对 BioProject 的通用定义表明,此类记录通常来自单一机构或联盟发起的单一计划,并汇集该项目产生的多种数据类型。关于该项目的具体研究背景、发起机构、资助信息及研究目标,源站未提供。
【数据内容】
从数据集名称可以了解,其内容涉及乳腺癌易感基因范围内的胚系变异,证据类型为全外显子。主题标签标注为“Other”。源站描述并未列出该项目所包含的具体文件类型、变异位点、基因清单、样本数量或数据格式。因此,关于数据内容的具体构成,源站未提供。
【采集与来源】
该数据来源于 ncbi.nlm.nih.gov 的 BioProject 记录,源站标题显示其物种为 Homo sapiens(ID 1486567)。BioProject 作为生物学数据集合,提供指向该项目各类数据的链接入口。关于样本采集方式、测序平台、建库策略、数据处理流程及质控标准,源站未提供。
【适用场景】
基于名称与主题,该数据集可用于研究乳腺癌易感基因的胚系变异分布与特征,并可作为全外显子证据相关分析的参考入口。由于源站未提供样本量、平台与基因列表等信息,其具体适用场景的边界与可支持的分析类型,源站未提供。
【使用方法】
该数据集以 BioProject 记录形式存在,用户可通过源站提供的链接入口查找该项目所生成的各类数据。关于数据下载方式、文件组织、访问权限及分析工具建议,源站未提供。
【质量与限制】
源站描述仅说明 BioProject 是围绕单一计划、来自单一机构或联盟的生物学数据集合,并提供指向该项目各类数据的链接入口,未提供样本量、测序平台、具体基因列表或分析结论。因此,关于数据质量、覆盖度、批次效应及使用限制的具体信息,源站未提供。
【引用与许可】
关于该数据集的引用方式、许可条款及使用限制,源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJEB112824
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
Research about the identification of Rare and Novel Genetic Variants in Selected Breast Cancer Genes
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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