低强度电磁场(Asha Therapy)治疗4T1原位乳腺肿瘤的CITE-seq数据

该数据集为CITE-seq数据,来自接受低强度电磁场(Asha Therapy,50 kHz、2 mT、25%占空比)治疗7天后的雌性BALB/c小鼠4T1原位乳腺肿瘤,并设未治疗对照(每组n=3)

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基因组分类GPL2424710090
PRJDB43337: In vivo manufacture of CAR therapeutic cells inhibits triple negative breast cancer with enhanced safety (PRJCA024602)

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-25

资源简介

低强度电磁场(Asha Therapy)治疗4T1原位乳腺肿瘤的CITE-seq数据

CITE-seq of 4T1 orthotopic mammary tumors treated with low-intensity electromagnetic field (Asha Therapy)

该数据集为CITE-seq数据,来自接受低强度电磁场(Asha Therapy,50 kHz、2 mT、25%占空比)治疗7天后的雌性BALB/c小鼠4T1原位乳腺肿瘤,并设未治疗对照(每组n=3)。肿瘤解离为单细胞后进行CITE-seq,质控后注释为恶性上皮细胞、中性粒细胞、巨噬细胞和单核细胞、T细胞及成纤维细胞等主要细胞群。数据可用于分析各细胞区室的细胞组成、差异基因表达、通路富集及表面标志物表达(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Oct 14 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):三阴性乳腺癌对免疫检查点阻断反应不佳。我们在雌性BALB/c小鼠中,对经Asha Therapy(一种非侵入性低强度电磁场,50 kHz、2 mT、25%占空比)治疗7天后的已建立原位4T1肿瘤的肿瘤微环境(TME)进行了分析,并与未治疗对照肿瘤进行比较(每组n=3)。肿瘤被解离为单细胞并通过CITE-seq进行分析。经过质量控制后,细胞被注释为主要细胞群,包括恶性上皮细胞、中性粒细胞、巨噬细胞和单核细胞、T细胞以及成纤维细胞。该数据集支持对每个区室的细胞组成、差异基因表达、通路富集和表面标志物表达进行分析。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL24247、10090。本站分类:肿瘤/乳腺癌。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE350789

【使用注意】

· 源站最后修改于 Oct 22 202,引用时请注意版本时效。

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

不同处理小鼠血液中mRNA的转录组学分析由上海美吉生物医药科技有限公司检测和分析。采用京都基因与基因组百科全书(KEGG)进行功能富集分析。该分析能够识别详细的基因表达信息,并确认缺氧调控的CAR表达在体内CAR重编程中的安全性。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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