Pin1/突变型p53共同调控基因
该数据集来自 omicsdi.org，属于肿瘤/乳腺癌分类下的转录组学数据，主题标签为 Transcriptomics。研究比较了对照、突变型p53敲低或Pin1敲低的 MDA-MB-231 乳腺癌细胞的转录组谱，每种条件设三个生物学重复（A、B、C），共 9 个样本，使用 Affymetrix 微
基本信息
资源简介
Pin1/突变型p53共同调控基因
该数据集来自 omicsdi.org，属于肿瘤/乳腺癌分类下的转录组学数据，主题标签为 Transcriptomics。研究比较了对照、突变型p53敲低或Pin1敲低的 MDA-MB-231 乳腺癌细胞的转录组谱，每种条件设三个生物学重复（A、B、C），共 9 个样本，使用 Affymetrix 微阵列进行杂交。数据可用于分析突变型p53与Pin1共同调控的基因表达程序，进而研究乳腺癌细胞侵袭和转移相关机制（来源 omicsdi.org）。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：为了研究突变型p53和Pin1控制乳腺癌细胞侵袭和转移所依赖的特异性基因表达程序，我们比较了对照、突变型p53敲低或Pin1敲低的MDA-MB-231细胞的转录组谱。MDA-MB-231细胞用针对Pin1、p53或作为对照的LacZ的siRNA转染两次。转染按照制造商的操作流程使用Lifofectamine 2000（Invitrogen）进行。第二次转染四十八小时后，样本随后进行总RNA提取并在Affymetrix微阵列上杂交。三种条件各使用三个生物学重复（A、B、C），共9个样本。
【主题与分类】
主题标签：Transcriptomics。本站分类：肿瘤/乳腺癌。
【获取与许可】
源站页面：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-26262
下载信息
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pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
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- OpenDataLab:
数据说明
为探究突变型p53与Pin1调控乳腺癌细胞侵袭和转移的具体基因表达程序，我们比较了对照组、突变型p53敲低组或Pin1敲低组MDA-MB-231细胞的转录组图谱。MDA-MB-231细胞分别针对Pin1、p53或作为对照的LacZ进行两次siRNA转染。转染按照制造商的操作规程，使用Lifofectamine 2000（Invitrogen）进行。第二次转染后48小时，处理样本以提取总RNA，并在Affymetrix微阵列上进行杂交。三种条件各设三个生物学重复（A、B、C），共计9个样本。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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需要用于商业化训练或医疗器械注册（NMPA/FDA）？
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连，提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。
