phs000851:非裔美国人乳腺癌 GWAS

数据以 Case-Control 设计组织,属于肿瘤与乳腺癌主题,可用于乳腺癌遗传关联分析、风险因素探索及病例与对照的分类建模等研究场景(来源 ncbi.nlm.nih.gov)

dbgap
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基因组分类Case-Control
phs000851: African American Breast Cancer GWAS

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-11-05

资源简介

phs000851:非裔美国人乳腺癌 GWAS

phs000851: African American Breast Cancer GWAS 是一个以病例-对照(Case-Control)设计组织的乳腺癌遗传学研究数据集,收录于 dbGaP 数据库,来源站点为 ncbi.nlm.nih.gov。该数据集在分类上归属于肿瘤 / 乳腺癌方向,主题标签为 Case-Control,核心用途围绕乳腺癌的遗传关联分析、风险因素探索以及病例与对照的分类建模等研究场景展开。作为一项聚焦非裔美国人乳腺癌的 GWAS 研究资源,它为研究者提供了从遗传变异角度考察乳腺癌发病风险的病例-对照数据基础,适合开展以人群为对象的关联研究与统计建模工作。

【数据集背景】

该数据集的全称为 phs000851: African American Breast Cancer GWAS,属于 dbGaP 收录的研究(study),采用病例-对照设计。其研究主题聚焦于非裔美国人群体的乳腺癌,属于肿瘤学与乳腺癌研究范畴。源站描述仅标明其为 dbGaP study(Case-Control),未提供更多关于研究发起背景、研究机构或立项动机的细节,源站未提供。

【数据内容】

数据集以病例-对照(Case-Control)设计组织,主题标签为 Case-Control,分类归属为肿瘤 / 乳腺癌。从设计类型看,数据应包含病例组与对照组两类样本,用于比较乳腺癌患者与非乳腺癌对照之间的遗传差异。关于具体的样本量、基因分型平台、标记位点数量、临床变量字段等细节,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov,收录于 dbGaP 数据库,属于 dbGaP study(Case-Control)。除来源站点与数据库归属外,关于样本采集地点、采集时间、招募方式、伦理审批等具体信息,源站未提供。

【适用场景】

依据其主题与设计,该数据集可用于乳腺癌遗传关联分析、风险因素探索,以及病例与对照的分类建模等研究场景。研究者可基于病例-对照结构,考察遗传变异与乳腺癌风险之间的关联,也可将其用于构建和评估区分病例与对照的统计或机器学习模型。由于聚焦非裔美国人群体,该数据在人群遗传学与健康差异相关研究中具有潜在应用价值。关于更具体的适用分析类型或推荐研究问题,源站未提供。

【使用方法】

该数据集为 dbGaP 收录的研究资源,通常需通过 dbGaP 的受控访问机制获取和使用。关于具体的申请流程、访问权限层级、数据下载格式、配套分析工具或操作步骤,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集采用病例-对照设计,此类设计在遗传关联研究中需注意对照选择、人群分层等潜在偏倚问题。关于该数据集的具体质量控制指标、样本排除标准、基因型 calling 质量、缺失率、批次效应处理等信息,源站未提供。使用者在解释关联结果时应结合设计特点谨慎推断因果关系。

【引用与许可】

该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov 的 dbGaP 数据库,使用时应遵循 dbGaP 的数据访问与使用政策。关于具体的引用格式、许可条款、数据使用协议细节或致谢要求,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/projects/gap/cgi-bin/study.cgi?study_id=phs000851

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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
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数据说明

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