phs000472:雌激素受体阳性乳腺癌芳香化酶抑制剂反应研究

该数据集为 dbGaP 收录的雌激素受体阳性乳腺癌芳香化酶抑制剂反应研究,采用肿瘤与配对正常组织对比设计,主题标签为 Tumor vs. Matched-Normal

dbgap
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基因组分类Tumor vs. Matched-Normal
phs000472: Estrogen Receptor Positive Breast Cancer: Aromatase Inhibitor Response Study

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-07

资源简介

phs000472:雌激素受体阳性乳腺癌芳香化酶抑制剂反应研究

phs000472: Estrogen Receptor Positive Breast Cancer: Aromatase Inhibitor Response Study 是收录于 dbGaP 的一项肿瘤学研究数据集,聚焦于雌激素受体阳性乳腺癌与芳香化酶抑制剂治疗反应之间的关系。该数据集在分类上归属于肿瘤与乳腺癌方向,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。其核心设计采用肿瘤组织与配对正常组织的对比策略,主题标签即为 Tumor vs. Matched-Normal。整体而言,该数据集为研究雌激素受体阳性乳腺癌在芳香化酶抑制剂治疗背景下的分子特征提供了以配对样本为基础的资源,适合围绕肿瘤与正常组织差异开展探索性分析。

【数据集背景】

该数据集所针对的疾病背景为雌激素受体阳性乳腺癌。雌激素受体阳性是乳腺癌中常见的分子亚型之一,其治疗常涉及内分泌治疗手段,芳香化酶抑制剂是其中一类重要药物。该数据集以“芳香化酶抑制剂反应研究”为名,表明其关注点在于接受此类治疗的患者群体及其反应特征。数据集被归入肿瘤 / 乳腺癌分类,来源为 ncbi.nlm.nih.gov 的 dbGaP 研究收录。关于该研究的具体发起机构、研究周期、样本量、随访时间等背景信息,源站未提供。

【数据内容】

依据源站描述,该数据集属于 dbGaP study,采用 Tumor vs. Matched-Normal 的设计。这意味着数据内容围绕肿瘤组织与来自同一患者的配对正常组织之间的对比展开。主题标签同样为 Tumor vs. Matched-Normal,进一步强调配对比较是该数据集的核心组织方式。关于具体的组学数据类型(如基因表达、突变、甲基化等)、数据文件格式、变量数量、样本数量及临床注释字段等,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,属于 dbGaP 收录的研究。dbGaP 是 NCBI 下属的基因型与表型数据库,通常用于存储与共享基因型、表型及关联研究数据。该数据集在来源站被描述为 dbGaP study (Tumor vs. Matched-Normal),表明其数据通过 dbGaP 平台进行归档与分发。关于样本采集的具体地点、时间、伦理审批信息、知情同意方式以及测序或检测平台等细节,源站未提供。

【适用场景】

基于其主题标签与设计,该数据集适用于需要比较肿瘤组织与配对正常组织差异的研究场景,尤其是与雌激素受体阳性乳腺癌及芳香化酶抑制剂反应相关的探索。潜在用途包括识别肿瘤与正常组织之间的分子差异、寻找与治疗反应相关的候选标志物,或作为二次分析中配对样本对照的参考资源。由于该数据集聚焦于特定亚型与特定治疗背景,其适用性可能局限于与之直接相关的研究问题。关于该数据集是否已被用于特定类型的分析或是否支持某种统计模型,源站未提供。

【使用方法】

该数据集通过 ncbi.nlm.nih.gov 的 dbGaP 平台提供。通常,dbGaP 数据的使用需要遵循其数据访问申请流程,可能涉及机构审查与数据使用协议。用户一般需在 dbGaP 上查找对应研究编号 phs000472,了解其可用的数据类型与访问级别,并按照平台指引提交申请。关于该数据集的具体下载方式、访问权限层级、是否需要受控访问审批以及可用的分析工具,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集采用肿瘤与配对正常组织对比的设计,配对策略有助于控制个体间差异,这是其方法学上的一个特点。然而,关于样本质量、数据完整性、批次效应、平台间一致性以及是否存在缺失数据等具体质量指标,源站未提供。此外,该数据集聚焦于雌激素受体阳性乳腺癌与芳香化酶抑制剂反应,其结论外推至其他乳腺癌亚型或其他治疗背景时需谨慎。关于该数据集的已知局限性、偏倚风险或验证情况,源站未提供。

【引用与许可】

该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov 的 dbGaP,研究编号为 phs000472。使用该数据集时,应遵循 dbGaP 平台及原研究方的数据使用与引用规范。关于具体的引用文献、许可协议类型、数据使用限制或商业使用规定,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/projects/gap/cgi-bin/study.cgi?study_id=phs000472

标准获取流程:

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  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

dbGaP study (Tumor vs. Matched-Normal).

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