Nanopore测序流程塑造肠道微生物组图谱：乳腺癌队列中全长16S与鸟枪法宏基因组比较
该数据集来自乳腺癌队列的肠道微生物组研究，比较Nanopore全长16S与鸟枪法宏基因组测序流程对微生物组图谱的影响。数据包含分类学丰度表、α与β多样性指标、分类器间相关性分析及结构零分析，支撑论文全部图表与补充材料
基本信息
资源简介
Nanopore测序流程塑造肠道微生物组图谱：乳腺癌队列中全长16S与鸟枪法宏基因组比较
Nanopore sequencing workfows shape gut microbiome profiling: full-length 16S versus shotgun metagenomics in a breast cancer cohort
该数据集来自乳腺癌队列的肠道微生物组研究，比较Nanopore全长16S与鸟枪法宏基因组测序流程对微生物组图谱的影响。数据包含分类学丰度表、α与β多样性指标、分类器间相关性分析及结构零分析，支撑论文全部图表与补充材料。原始数据存放于EBI BioProject PRJEB108219。可用于评估不同测序策略在肿瘤微生物组研究中的一致性与差异，支持生物信息学方法比较与可重复性分析（来源 DOI 解析，MIT License 许可）。
【数据集背景】
源站首次发布：2026。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：该存储库包含与手稿“Nanopore测序流程塑造肠道微生物组图谱：乳腺癌队列中全长16S与鸟枪法宏基因组比较”相关的源数据和补充表格。数据集包括分类学丰度表、α与β多样性指标、分类器间相关性分析以及结构零分析。这些数据支撑手稿中展示的所有图表和补充材料。原始数据可在EBI BioProject: PRJEB108219下获取。
【主题与分类】
主题标签：RNA, Ribosomal, 16S、Metagenomics、Whole Genome Sequencing、Microbiota、Nanopore Sequencing、Bioinformatics。本站分类：肿瘤/乳腺癌。
【获取与许可】
源站页面：https://zenodo.org/doi/10.5281/zenodo.23470209
使用许可：MIT License。
下载信息
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源站：https://doi.org/10.5281/zenodo.23470209
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pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据集大小约 81.3 MB。
数据说明
本仓库包含与手稿《Nanopore测序工作流程塑造肠道微生物组分析：乳腺癌队列中全长16S与鸟枪法宏基因组学的比较》相关的源数据和补充表格。数据集包括分类学丰度表、α多样性和β多样性指标、分类器之间的相关性分析以及结构零分析。这些数据支持手稿中呈现的所有图表和补充材料。原始数据可在EBI BioProject：PRJEB108219下获取。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册（NMPA/FDA）？
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连，提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。
