乳腺癌亚型及正常组织的mRNA测序数据
数据基于RNA-sequencing技术，旨在定义三种亚型的数字转录组，并解析差异表达的已知与新型转录本、可变剪接基因、差异异构体及表达变异
基本信息
资源简介
乳腺癌亚型及正常组织的mRNA测序数据
mRNA-sequencing of breast cancer subtypes and normal tissue
该数据集为来自ebi.ac.uk的乳腺癌mRNA测序数据，涵盖TNBC、Non-TNBC和HER2-positive三种乳腺癌亚型及正常组织，样本由Baylor College of Medicine提供并经IRB程序使用。数据基于RNA-sequencing技术，旨在定义三种亚型的数字转录组，并解析差异表达的已知与新型转录本、可变剪接基因、差异异构体及表达变异。比较转录组分析已揭示三组间的差异表达转录本并鉴定出若干新的乳腺癌调节因子，可用于乳腺癌亚型分子机制研究与生物标志物发现（来源 BioStudies）。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：目标：利用RNA测序技术定义三种乳腺癌亚型（TNBC、Non-TNBC和HER2阳性）的数字转录组。阐明数据集中差异表达的已知和新型转录本、可变剪接基因、差异异构体以及最后表达的变异。方法：Suzanne Fuqua博士（Baylor College of Medicine）提供了人乳腺癌组织RNA样本。所有人类样本均按照Baylor College of Medicine的IRB程序使用。乳腺癌类型TNBC、Non-TNBC和HER2阳性基于免疫组织化学和RT-qPCR分类进行划分。结果：比较转录组分析阐明了三个乳腺癌组之间的差异表达转录本，鉴定出若干新的乳腺癌调节因子。我们发现了亚型特异性的差异剪接
【主题与分类】
主题标签：RNA-seq of coding RNA、Homo sapiens。本站分类：肿瘤/乳腺癌。
【获取与许可】
源站页面：https://ebi.ac.uk/biostudies/arrayexpress/studies/E-GEOD-52194
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ebi.ac.uk/biostudies/arrayexpress/studies/E-GEOD-52194
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据缺失？
依托陕西、四川两大基地，我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系，覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程，为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。
⚡️ 需要数据支持或标注服务？立即联系我们获取专业方案。
