早期原发性乳腺癌microRNA表达谱预后标志物及通路研究
该数据集来自omicsdi.org，收录210例早期原发性乳腺癌患者的microRNA表达谱数据，患者均具备完整的10年随访、临床与人口学信息
基本信息
资源简介
早期原发性乳腺癌microRNA表达谱预后标志物及通路研究
该数据集聚焦于早期原发性乳腺癌的microRNA表达谱，旨在识别与预后相关的标志物及其关联通路。数据来自omicsdi.org，属于肿瘤/乳腺癌分类下的转录组学主题。数据集收录了210例早期原发性乳腺癌患者，这些患者均具备完整的10年随访信息以及临床与人口学资料。患者接受过手术，时间跨度为1989年至1992年，术后接受辅助化疗和/或辅助内分泌治疗，或未接受辅助治疗。对于雌激素受体阳性（ER+）乳腺癌患者，他莫昔芬作为内分泌治疗使用5年。该数据集为回顾性临床研究，通过microRNA表达谱分析，探索乳腺癌预后标志物及相关生物学通路。
【数据集背景】
该数据集来源于一项回顾性临床研究，研究对象为1989年至1992年间接受手术的原发性乳腺癌患者。研究目的是通过microRNA表达谱分析，识别乳腺癌的预后标志物以及与之相关的信号通路。患者群体接受了不同的辅助治疗方案，包括辅助化疗和/或辅助内分泌治疗，部分患者未接受辅助治疗。对于ER+乳腺癌患者，他莫昔芬被用作内分泌治疗，持续5年。此外，对于肿瘤直径3厘米、接受辅助环磷酰胺、甲氨蝶呤和5-氟尿嘧啶（CMF）方案六个周期、每周三次静脉给药的患者，以及年龄大于50岁、ER阴性、淋巴结阳性的肿瘤患者，也接受了CMF治疗。该研究设计为回顾性临床研究，旨在通过分子表达谱数据与长期随访信息相结合，探索乳腺癌预后相关分子特征。
【数据内容】
该数据集包含210例早期原发性乳腺癌患者的microRNA表达谱数据。这些患者均具有完整的10年随访记录，以及临床和人口学信息。数据主题标签为Transcriptomics，表明其属于转录组学范畴。microRNA表达谱数据可用于分析不同患者之间microRNA表达水平的差异，进而与预后信息关联。数据集未提供具体的microRNA数量、检测平台或表达值范围等细节，源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来自omicsdi.org。源站描述指出，患者为1989年至1992年间接受手术的原发性乳腺癌患者，接受辅助化疗和/或辅助内分泌治疗，或未接受辅助治疗。他莫昔芬用于ER+乳腺癌患者的内分泌治疗，持续5年。对于特定患者群体，如肿瘤直径3厘米、接受CMF方案六个周期、每周三次静脉给药者，以及年龄大于50岁、ER阴性、淋巴结阳性的肿瘤患者，也接受了CMF治疗。研究为回顾性临床研究，旨在识别乳腺癌预后标志物及相关通路。数据采集的具体时间、地点和伦理审批信息，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于乳腺癌预后标志物的发现与验证研究，特别是基于microRNA表达谱的预后分析。可用于探索microRNA表达与患者生存、治疗反应及临床病理特征之间的关联。也可用于研究乳腺癌相关信号通路，以及不同辅助治疗模式下microRNA表达的差异。此外，该数据集可用于转录组学分析方法的开发与验证，以及与其他乳腺癌数据集的整合分析。由于包含完整的10年随访信息，适合进行长期预后相关研究。
【使用方法】
使用该数据集时，可结合临床与人口学信息，对microRNA表达谱数据进行统计分析，如差异表达分析、生存分析、通路富集分析等。可根据治疗情况（辅助化疗、内分泌治疗或未治疗）进行分层分析。由于数据为回顾性研究，需注意混杂因素的控制。具体的数据格式、预处理步骤、归一化方法及分析工具，源站未提供。用户需根据数据实际结构自行处理。
【质量与限制】
该数据集基于回顾性研究设计，样本量为210例，具有完整的10年随访信息。然而，源站未提供数据质量评估、缺失值情况、批次效应或技术重复等信息。由于是回顾性研究，可能存在选择偏倚和信息偏倚。此外，患者治疗背景多样，可能影响结果解释。数据的具体检测平台、microRNA覆盖范围及表达值可靠性，源站未提供。使用时应谨慎考虑这些限制。
【引用与许可】
该数据集的引用方式、许可协议及使用限制，源站未提供。用户在使用前应查阅omicsdi.org上的相关说明，并遵循源站的要求。
下载信息
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需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-22216
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
回顾性系列研究，纳入1989年至1992年间接受手术的原发性乳腺癌患者。患者接受了辅助化疗和/或辅助激素治疗，或未接受辅助治疗。ER+乳腺癌患者使用他莫昔芬作为内分泌治疗，持续5年。直径3厘米的患者接受了辅助环磷酰胺、甲氨蝶呤和5-氟尿嘧啶（CMF）治疗，共六个周期，采用每周三次的静脉给药方案。年龄>50岁、ER–、淋巴结阳性的肿瘤患者也接受了CMF治疗。这是一项回顾性临床研究，旨在识别乳腺癌预后标志物及相关通路。研究考虑了210例早期原发性乳腺癌患者，这些患者具有完整的10年随访、临床和人口统计学信息。miRNA表达谱数据。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册（NMPA/FDA）？
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连，提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。
