浸润性小叶癌样本微阵列基因表达数据(RATHER)
该数据集来自 RATHER 联盟,采用微阵列技术对 144 例未经治疗的 primary invasive lobular carcinoma(ILC)乳腺肿瘤组织及 15 个 ILC 细胞系进行基因表达谱分析

基本信息
资源简介
浸润性小叶癌样本微阵列基因表达数据(RATHER)
该数据集名为 Microarray based gene expression for invasive lobular cancer samples (RATHER),属于肿瘤 / 乳腺癌分类,主题标签为 Transcriptomics,来源站为 omicsdi.org。数据集来自 RATHER 联盟(RAtional THERapy for breast cancer: individualized treatment for difficult-to-treat breast cancer subtypes),采用微阵列技术对 144 例未经治疗的 primary invasive lobular carcinoma(ILC)乳腺肿瘤组织以及 15 个 ILC 细胞系进行基因表达谱分析。整体而言,该数据集聚焦于浸润性小叶癌这一乳腺癌亚型的转录组层面表达信息,覆盖肿瘤组织与细胞系两类样本,可为相关研究提供基因表达谱数据基础。
【数据集背景】
该数据集产生于 RATHER 联盟的研究框架。RATHER 的全称为 RAtional THERapy for breast cancer: individualized treatment for difficult-to-treat breast cancer subtypes,即针对难以治疗的乳腺癌亚型开展个体化治疗的理性治疗研究。浸润性小叶癌(invasive lobular carcinoma,ILC)是乳腺癌的一种亚型,该数据集正是围绕这一亚型构建的基因表达谱资源,旨在为难以治疗的乳腺癌亚型研究提供表达层面的数据支撑。
【数据内容】
数据集的核心内容是基因表达谱数据。样本包括 144 例未经治疗的 primary invasive lobular carcinoma(ILC)乳腺肿瘤组织,以及 15 个 ILC 细胞系。全部样本均通过微阵列(microarray)技术完成表达谱分析。数据覆盖肿瘤组织与细胞系两种来源,主题归属于转录组学(Transcriptomics)。
【采集与来源】
数据来源于 omicsdi.org 站点。样本采集方面,144 例肿瘤组织均为未经治疗的 primary ILC 乳腺肿瘤组织,另有 15 个 ILC 细胞系;检测手段为微阵列基因表达谱分析。这些工作是在 RATHER 联盟框架下完成的。关于具体的样本采集地点、时间范围、伦理审批信息以及微阵列平台型号等细节,源站未提供。
【适用场景】
基于其内容构成,该数据集适用于浸润性小叶癌(ILC)相关的基因表达研究,例如对 ILC 肿瘤组织与 ILC 细胞系表达谱的比较分析、ILC 亚型转录组特征的探索,以及围绕难以治疗的乳腺癌亚型开展的个体化治疗相关研究。数据集的主题标签为 Transcriptomics,表明其用途集中在转录组层面。关于具体的分析应用方向与验证结论,源站未提供。
【使用方法】
源站未提供该数据集的具体使用方式,包括数据下载格式、文件组织方式、预处理流程以及分析工具建议等。使用者需依据来源站 omicsdi.org 的说明获取进一步信息。
【质量与限制】
该数据集包含 144 例未经治疗的 primary ILC 肿瘤组织与 15 个 ILC 细胞系的微阵列表达谱,样本数量与样本类型已在源站描述中明确。关于数据质量评估指标、缺失值情况、批次效应处理以及数据局限性等,源站未提供。
【引用与许可】
源站未提供该数据集的引用方式与许可信息。使用者在使用该数据集时,应参考来源站 omicsdi.org 及 RATHER 联盟的相关说明。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-68057
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
作为RATHER(RAtional THERapy for breast cancer: individualized treatment for difficult-to-treat breast cancer subtypes,乳腺癌理性治疗:难治性乳腺癌亚型的个体化治疗)联盟的一部分,采用微阵列技术对144例未经治疗的原发性浸润性小叶癌(ILC)乳腺组织及15株ILC细胞系进行了表达谱分析。对144例ILC乳腺癌及15株ILC细胞系进行了基因表达谱分析
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