番茄叶片提取物处理MCF-7乳腺癌细胞的基因表达谱微阵列分析

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-33443

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

本研究采用微阵列分析方法，评估了经番茄叶提取物(TLE)处理1小时和48小时的MCF-7乳腺癌细胞全局基因表达谱的变化。处理后，来自人类基因组的多个基因在p值小于0.05且倍数变化阈值小于2.00的条件下显示出显著改变，这些基因在癌细胞生长中扮演重要角色，且在治疗后呈现下调或上调趋势。TLE对多个基因如CRYAB、PIM1、BTG1、CYR61、HIF1A、CEBP-beta、TXNIP、THBS1、HMG1L1及HIST2H3D等展现出显著的表达影响，证明了TLE作为抗癌剂的强大潜力。我们利用Affymetrix人类外显子1.0 ST平台，对未处理(0小时)及处理后的MCF-7乳腺癌细胞(1小时和48小时后)进行了分析。芯片阵列通过Affymetrix微阵列套件/GCOS扫描，实验重复三次。原始数据经由GeneSpringGX v7.2软件(美国安捷伦科技公司)处理。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。