MERFISH 4T1 细胞培养原始未对齐图像
该数据集为在受控体外条件下培养的小鼠乳腺癌细胞系 4T1 的 MERFISH 原始未对齐图像，包含 15 个视野（FOV），每个视野有 15 个 z 切片，空间分辨率为每像素 0.024 μm，每个视野覆盖 1608 × 1608 像素区域
基本信息
资源简介
MERFISH 4T1 细胞培养原始未对齐图像
MERFISH 4T1 Cell-Culture Raw Unaligned Images
该数据集为在受控体外条件下培养的小鼠乳腺癌细胞系 4T1 的 MERFISH 原始未对齐图像，包含 15 个视野（FOV），每个视野有 15 个 z 切片，空间分辨率为每像素 0.024 μm，每个视野覆盖 1608 × 1608 像素区域。数据按每个视野的成像轮次组织，共 9 个成像轮次，更多信息见数据组织 csv。该数据可用于乳腺癌细胞的空间转录组分析、细胞分割与基因表达定位等研究（来源 DOI 解析）。
【数据集背景】
源站首次发布：2025。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：该培养细胞数据集由从 4T1 细胞培养物中获取的 MERFISH 图像组成，4T1 是一种在受控体外条件下生长的小鼠乳腺癌细胞系。该数据集包含 15 个视野（FOV），每个视野有 15 个 z 切片，采集空间分辨率为每像素 0.024 μm。每个视野覆盖 1608 × 1608 像素区域。数据集按每个视野的成像轮次组织。共有 9 个成像轮次。更多信息可在数据组织 csv 中找到。
【主题与分类】
主题标签：Medicine, Health and Life Sciences、MERFISH dataset。本站分类：肿瘤/乳腺癌。
【获取与许可】
源站页面：https://dataverse.harvard.edu/citation?persistentId=doi:10.7910/DVN/NE0WOP
下载信息
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使用方式
数据集获取
源站：https://doi.org/10.7910/DVN/NE0WOP
标准获取流程：
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- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据集大小约 31.42 GB。
数据说明
培养细胞数据集由从4T1细胞培养物中获取的MERFISH图像组成，4T1是一种在受控体外条件下培养的小鼠乳腺癌细胞系。该数据集包含15个视野（FOV），每个视野有15个z切片，以每像素0.024 μm的空间分辨率获取。每个视野覆盖1608 × 1608像素的区域。数据集按每个视野的成像轮次组织。共有9个成像轮次。更多信息可在数据组织csv文件中找到。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册（NMPA/FDA）？
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连，提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。
