大鼠5号染色体Emca8位点内三个雌激素诱导乳腺癌易感遗传决定因素的定位

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-39788

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数据说明

我们正在使用17β-雌二醇诱导的ACI大鼠乳腺癌模型，以明确雌激素促进乳腺癌发展的机制；识别并功能性地描述决定易感性的遗传变异；以及在此生理相关的大鼠模型中，界定影响乳腺癌发生的激素-基因-环境相互作用。雌性ACI大鼠在持续接受生理水平的17β-雌二醇处理时，独特地易于发生乳腺癌。雌性ACI大鼠中乳腺癌的诱导主要通过一种很大程度上依赖于雌激素受体α的机制实现。对易感性ACI大鼠与抵抗性Brown Norway (BN)大鼠杂交后代进行的区间定位分析揭示了七个数量性状位点(QTL)，命名为Emca3（雌激素诱导的乳腺癌）至Emca9，每个位点均含有一个或多个乳腺癌易感性的遗传决定因素。位于RNO5上的Emca8区域内，在17β-雌二醇处理的ACI大鼠与ACI.BN-Emca8同类系大鼠之间表达存在差异的基因，被确定为Emca8的候选基因。

比较了两组接受17β-雌二醇治疗的雌性大鼠。五只ACI大鼠和五只BN.ACI-Emca8大鼠接受了为期12周的17β-雌二醇治疗。从这些动物的乳腺中提取总RNA，标记后与Affymetrix大鼠基因组230 2.0芯片（Affymetrix公司）杂交。在这两组之间发现了显著差异表达的基因。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。