配体-受体相互作用诱导并介导BATF3+ B细胞的调控功能

数据集获取

源站：https://search.dataone.org/view/sha256%3A88e3e464c2799f8c4769be69e8bac3d37ccd1af704ce428da3467c26131b2bfe

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
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数据说明

B细胞表达蛋白配体，其潜在调控功能仍未完全阐明。在此，我们分析了小鼠B细胞亚系细胞中的配体表达，包括经特定受体信号激活的细胞，并通过计算机模拟分析配体-受体相互作用，评估了它们的调控能力和特异性。我们鉴定出一个B细胞亚群，其特异性表达细胞因子IL-27和趋化因子CXCL10。通过IL-27-IL-27受体相互作用，产生IL-27/CXCL10的B细胞在体外靶向CD40激活的B细胞，并且在免疫接种和病毒感染诱导后，在体内优化了抗体应答和抗病毒免疫。它们也存在于乳腺癌肿瘤中，并通过CXCL10-CXCR3相互作用介导的自我靶向滞留于其中，促进B细胞PD-L1表达和免疫逃逸。

在机制上，Il27和Cxcl10的转录是由TLR和CD40信号协同诱导的，并由共诱导的转录因…介导。，# 数据来源：配体-受体相互作用诱导并介导BATF3+ B细胞的调节功能 数据集DOI：10.5061/dryad.r4xgxd2rr ## 数据描述 本研究产生了多个数据集，包括体外刺激B细胞的bulk RNA-Seq、体内病毒感染小鼠分选B细胞的bulk RNA-Seq、BATF3和NF-kappaB（RELA亚基）结合基因组DNA的CUT&Tag和ChIP-Seq、用于分析组蛋白修饰的CUT&Tag，以及体外刺激B细胞中蛋白质表达的串联质谱。该研究还通过标准化B细胞（体外和体内）的bulk RNA-Seq以及来自ImmGen数据集的数据进行了整合分析，共得到代表46个免疫细胞谱系/亚谱系的225个样本。利用标准化数据，研究计算了每种细胞类型中的基因表达特异性评分，并量化了每个细胞间通讯中的配体-受体相互作用。 ## **文件和变量…

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。