正常人类乳腺不同细胞类型DNA损伤反应研究

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-67595

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
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     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

对不同乳腺癌亚型细胞起源的兴趣日益增长，促使研究者对正常乳腺上皮的亚群及其分化层级展开探索。多个研究团队已证明，基底样乳腺癌可能起源于腔面祖细胞。然而，为何某种乳腺细胞类型更易发生转化，其分子与细胞机制尚待阐明。为观察不同细胞亚群对电离辐射（IR）反应的分子差异，我们对MUC1+分选和CD10+分选的原代人乳腺上皮细胞培养物进行了基因表达谱分析。采用Illumina HumanHT-12 v4表达珠芯片，在2 Gy和5 Gy IR处理后2小时和24小时检测转录反应。完整样本队列包括来自总共5例个体患者的时间点匹配的未处理（0 Gy）对照。我们的分析表明，不同细胞类型对IR的反应存在若干特异性差异。

从经MUC1+分选和CD10+分选的原代人乳腺上皮细胞培养物中提取RNA，提取时间点分别为经0、2和5 Gy电离辐射处理后的2小时和24小时（每位患者12份样本），共涉及5位独立患者。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。