肿瘤内异质性与基于微阵列的乳腺癌生物学及临床结局预测因子的精确性

对18例乳腺癌患者的50份核心针活检样本,采用Affymetrix GeneChip Human Genome Plus 2.0 Arrays进行全基因组表达谱分析,使用无监督聚类和方差分量模型刻画全局表达谱,并以类间相关评估乳腺癌生物学与临床结局预测因子的精确性

omicsdi
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基因组预测Transcriptomics
Intratumor Heterogeneity and Precision of Microarray-Based Predictors of Breast Cancer Biology and Clinical Outcome

基本信息

模态
基因组
任务类型
预测
创建/更新时间
2026-11-03

资源简介

肿瘤内异质性与基于微阵列的乳腺癌生物学及临床结局预测因子的精确性

对18例乳腺癌患者的50份核心针活检样本,采用Affymetrix GeneChip Human Genome Plus 2.0 Arrays进行全基因组表达谱分析,使用无监督聚类和方差分量模型刻画全局表达谱,并以类间相关评估乳腺癌生物学与临床结局预测因子的精确性。标签为转录组学(来源 omicsdi.org)。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):采用 Affymetrix GeneChip Human Genome Plus 2.0 芯片对来自18例乳腺癌患者的50份空芯针穿刺活检标本进行了全基因组表达谱分析。使用无监督聚类方法和方差分量模型对整体表达谱进行了表征。通过组间相关系数评估了乳腺癌生物学和临床结局预测因子的精确性。

【主题与分类】

主题标签:Transcriptomics。本站分类:肿瘤/乳腺癌。

【获取与许可】

源站页面:https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-23593

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    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

采用 Affymetrix GeneChip Human Genome Plus 2.0 芯片对来自18例乳腺癌患者的50份空芯针穿刺活检标本进行了全基因组表达谱分析。使用无监督聚类方法和方差分量模型对整体表达谱进行了表征。通过组间相关系数评估了乳腺癌生物学和临床结局预测因子的精确性。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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