乳腺癌内部验证队列:用于ClinicoMolecular Triad Classification开发
该数据集为乳腺癌内部验证队列,来源于omicsdi.org,属于肿瘤/乳腺癌主题,标签为Transcriptomics。源站描述显示,早期研究基于161例乳腺癌患者训练队列建立了ClinicoMolecular Triad Classification(CMTC),本队列补充收集340例乳腺癌患者(

基本信息
资源简介
乳腺癌内部验证队列:用于ClinicoMolecular Triad Classification开发
该数据集为乳腺癌内部验证队列,来源于omicsdi.org,属于肿瘤/乳腺癌主题,标签为Transcriptomics。源站描述显示,早期研究基于161例乳腺癌患者训练队列建立了ClinicoMolecular Triad Classification(CMTC),本队列补充收集340例乳腺癌患者(2008至2010年)用于CMTC开发,共采集340份无重复的乳腺肿瘤细针穿刺(FNA)标本进行微阵列检测,最终284例浸润性乳腺癌纳入研究。数据可用于乳腺癌分子分型与预后预测模型的验证与开发(来源 omicsdi.org)。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):在我们早期的研究([GEO Accession: GSE16987],[PMID: 21939527])中,我们利用包含161例乳腺癌患者(2003至2008年)的训练队列,创建了ClinicoMolecular Triad Classification(CMTC),以改善乳腺癌的预测和预后判断。此处,我们收集了一个包含340例乳腺癌患者(2008至2010年)的补充内部验证队列,用于CMTC的开发。共采集了340份来自乳腺肿瘤的无重复细针穿刺(FNA)标本,并制备用于微阵列检测。最终,本研究使用了284例浸润性乳腺癌。
【主题与分类】
主题标签:Transcriptomics。本站分类:肿瘤/乳腺癌。
【获取与许可】
源站页面:https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-45725
下载信息
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数据集获取
源站:https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-45725
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
在我们早期的研究([GEO登录号:GSE16987],[PMID:21939527])中,我们创建了一种临床分子三联分类(ClinicoMolecular Triad Classification, CMTC),通过使用包含161名乳腺癌患者(2003年至2008年)的训练队列来改进乳腺癌的预测和预后评估。在此,我们收集了一个包含340名乳腺癌患者(2008年至2010年)的补充内部验证队列,用于CMTC的开发。共收集了340份来自乳腺肿瘤的细针穿刺(FNA)标本(无重复),并制备用于微阵列检测。最终,本研究使用了284例浸润性乳腺癌。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。




