HTAN-OHSU

HTAN-OHSU数据集包含转移性乳腺癌耐药机制研究的DICOM切片显微镜图像,涉及HRBC和TNBC两种亚型的治疗方案。

National Cancer InstituteNational Cancer Institute
NCI Imaging Data Commons
浏览 4
医学影像乳腺癌耐药医学影像
HTAN-OHSU

基本信息

模态
医学影像
创建/更新时间
2026-11-03

资源简介

该数据集源自NCI成像数据共享中心,由HTAN OMS Atlas中心提供,旨在揭示转移性乳腺癌对靶向治疗和免疫检查点抑制剂产生耐药性的机制。数据集包含DICOM格式的切片显微镜图像,主要关注激素受体阳性乳腺癌(HRBC)接受CDK4/6抑制剂联合内分泌治疗,以及三阴性乳腺癌(TNBC)接受PARP抑制剂和免疫调节剂治疗两种临床试验场景下的耐药机制。

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使用方式

数据集获取

源站:https://portal.imaging.datacommons.cancer.gov/collections/htan_ohsu/

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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