早期乳腺癌中的Hsa-miR-375
该数据集来自omicsdi.org，聚焦早期乳腺癌患者保乳治疗后局部复发与否的microRNA差异表达。研究分试点与验证两阶段：先用微阵列技术在1250个miR中筛查32例患者的最失调miR，再用RT-qPCR在115例独立队列中分析候选miR
基本信息
资源简介
早期乳腺癌中的Hsa-miR-375
Hsa-miR-375 in early breast cancer 是一个聚焦早期乳腺癌的转录组学数据集，来源于 omicsdi.org，在站内归入肿瘤 / 乳腺癌分类。该数据集围绕一个明确的临床问题展开：在早期乳腺癌患者接受保乳治疗后，能否通过 microRNA 表达差异区分出现局部复发与未出现局部复发的患者。研究采用试点与验证两阶段设计，先以微阵列技术在 1250 个 miR 中对 32 例患者筛查失调最显著的 miR，随后在 115 例独立队列中用逆转录定量聚合酶链反应（RT-qPCR）分析候选 miR。数据集主题标签为 Transcriptomics，其核心价值在于为个体化治疗选择提供分子层面的分层线索。
【数据集背景】
早期乳腺癌患者接受保乳治疗后，部分患者会出现局部复发，而另一部分不会。如何在治疗前或治疗早期识别复发风险不同的患者，直接关系到个体化治疗方案的制定。该研究正是以这一临床需求为出发点，目标是找出能够区分保乳治疗后有无局部复发患者的 microRNA。研究设计分为试点阶段和验证阶段，以保证候选标志物在独立人群中的可重复性。
【数据内容】
数据集的核心内容是 microRNA 表达层面的差异信息。试点阶段在 1250 个 miR 组成的 panel 中，对 32 例患者进行微阵列筛查，识别出失调最显著的 miR；验证阶段则针对候选 miR，在 115 例患者的独立队列中采用 RT-qPCR 进行检测分析。数据集名称中出现的 Hsa-miR-375 提示该 microRNA 是研究关注的对象之一。除上述 microRNA 表达检测信息外，源站未提供关于数据文件格式、样本临床注释字段、表达矩阵规模等更细的内容说明。
【采集与来源】
数据来源于 omicsdi.org。研究样本来自早期乳腺癌患者，分为试点阶段的 32 例和验证阶段的 115 例独立队列。检测技术包括两个层次：试点阶段使用微阵列技术进行高通量筛查，验证阶段使用逆转录定量聚合酶链反应进行候选 miR 的定量分析。源站未提供样本采集地点、采集时间、伦理审批信息及具体平台型号等细节。
【适用场景】
该数据集适用于探索早期乳腺癌保乳治疗后局部复发的 microRNA 相关标志物研究，可用于候选 microRNA 的发现与独立验证思路参考，也适合作为转录组学层面研究乳腺癌复发分层的辅助资料。由于研究聚焦于治疗后的局部复发区分，其潜在应用方向与个体化治疗选择相关。源站未提供该数据集在其他癌种、其他治疗方式或其他临床终点上的适用性说明。
【使用方法】
使用该数据集时，可参照其两阶段研究结构理解数据：先关注微阵列筛查阶段在 1250 个 miR 中筛选出的最失调 microRNA，再结合 RT-qPCR 验证阶段在 115 例独立队列中的候选 miR 分析结果。源站未提供具体的数据下载方式、文件组织说明、预处理流程或分析代码，使用前需另行确认数据获取途径与格式。
【质量与限制】
该研究采用试点加验证的两阶段设计，并在独立队列中通过 RT-qPCR 对候选 microRNA 进行验证，这一结构有助于提升候选标志物的可靠性。但源站未提供样本量之外的统计效能评估、批次效应处理、缺失值情况、平台间一致性等技术细节，也未说明研究结论的验证程度与适用范围。数据集名称中提及 Hsa-miR-375，但源站描述未给出该 microRNA 的具体效应方向或性能指标，相关解读需以原始研究为准。
【引用与许可】
源站未提供该数据集的引用方式、发表文献信息及许可条款。使用或再分发前，应向数据来源方确认引用规范与授权要求。
下载信息
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暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
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使用方式
数据集获取
源站：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-69951
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
本研究旨在识别能够区分早期乳腺癌保乳治疗后有无局部复发患者的miR，这在个体化治疗选择的背景下尤为重要。该研究分为试点阶段和验证阶段。首先，通过微阵列技术在一组1250个miR中对32例患者进行筛选，以找出最失调的miR。其次，使用逆转录定量聚合酶链反应（RT-qPCR）在一个独立的115例患者队列中对候选miR进行分析。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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