HHEX/PRH敲低或过表达后的基因表达变化

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE94865

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

乳腺肿瘤从增生进展为导管原位癌（DCIS）和浸润性乳腺癌（IBC）。PRH/HHEX（富含脯氨酸同源结构域/造血表达同源盒）是一种转录因子，在不同疾病背景下既表现出肿瘤抑制活性，也表现出致癌活性，然而PRH在乳腺癌中的作用尚不清楚。为确定PRH功能缺失在乳腺癌细胞中的后果，我们在MCF-7细胞中建立了可诱导的PRH敲低。我们发现，PRH敲低导致MCF-7细胞增殖增加，其部分原因至少是血管内皮生长因子信号传导增强。此外，我们证明PRH敲低增加了具有癌症干细胞样特性的乳腺癌细胞的形成。最后，与这些发现一致，我们表明PRH过表达抑制小鼠乳腺肿瘤的生长。总体而言，这些数据表明PRH在乳腺中发挥肿瘤抑制作用，并为低PRH mRNA水平与乳腺癌不良预后相关的发现提供了解释。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。