人乳腺癌细胞中siRNA敲低ING2后基因表达检测数据集

源站描述指出Sin3/HDAC复合物含至少17个亚基,ING2为其非催化组分,研究还评估了HDAC抑制剂SAHA对复合物网络及基因表达的影响

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基因组分类Expression profiling by arrayGPL5709606
GSE60123: Examination of gene expression in response to ING2 knockdown by siRNA in human breast cancer cells

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-27

资源简介

人乳腺癌细胞中siRNA敲低ING2后基因表达检测数据集

Examination of gene expression in response to ING2 knockdown by siRNA in human breast cancer cells

该数据集来自NCBI GEO(GSE60123),记录人乳腺癌细胞中通过siRNA敲低ING2后的基因表达变化,采用表达谱芯片(GPL570,9606)检测,仅含1个文件(GSE60123_series_matrix.txt.gz)。源站描述指出Sin3/HDAC复合物含至少17个亚基,ING2为其非催化组分,研究还评估了HDAC抑制剂SAHA对复合物网络及基因表达的影响。数据可用于分析ING2敲低与SAHA处理下的转录响应,支持乳腺癌相关基因表达模式与HDAC抑制剂机制研究(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Aug 05 201。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):Sin3/HDAC多蛋白复合物由至少17个亚基组成,已知在包括转录、染色质结构和细胞周期在内的多种生物学和细胞过程中发挥作用。ING2是该复合物的非催化组分。为了更好地从机制上理解Sin3/HDAC复合物在癌症中的作用,我们扩展了其蛋白质-蛋白质相互作用网络,并鉴定了复合物内一对互斥的配对。辛二酰苯胺异羟肟酸(SAHA)是一种FDA批准的HDAC抑制剂,用于治疗皮肤T细胞淋巴瘤。我们通过六个同源诱饵评估了SAHA对复合物网络破坏的影响。SAHA干扰多种蛋白质相互作用,因此损害了Sin3/HDAC网络大部分区域的组成。将SAHA处理对乳腺癌细胞基因表达的影响与一个

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:Expression profiling by array、GPL570、9606。本站分类:肿瘤/乳腺癌。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE60123

【使用注意】

· 源站最后修改于 Mar 25 201,引用时请注意版本时效。

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    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Sin3/HDAC多蛋白复合物至少由17个亚基组成,已知在多种生物学和细胞过程中发挥作用,包括转录、染色质结构和细胞周期。ING2是该复合物的一个非催化组分。为了更好地从机制上理解Sin3/HDAC复合物在癌症中的作用,我们扩展了其蛋白质-蛋白质相互作用网络,并鉴定了复合物内一对互斥的配对关系。辛二酰苯胺异羟肟酸(SAHA)是一种获FDA批准、用于治疗皮肤T细胞淋巴瘤的HDAC抑制剂。我们通过六种同源诱饵评估了SAHA对复合物网络破坏的影响。SAHA扰乱了多种蛋白质相互作用,因而损害了Sin3/HDAC网络大部分区域的组成。将SAHA处理对乳腺癌细胞基因表达的影响与ING2亚基敲低进行比较表明,SAHA的部分抗癌作用可能归因于破坏了ING2与该复合物的结合。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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