过表达转录因子Snail的乳腺癌细胞系MCF-7表达数据
该数据集来自NCBI GEO，收录乳腺癌细胞系MCF-7在异位表达转录因子Snail后的基因表达谱芯片数据，采用GPL570平台，共1个文件
基本信息
资源简介
过表达转录因子Snail的乳腺癌细胞系MCF-7表达数据
GSE58252 数据集来自 NCBI GEO，收录了乳腺癌细胞系 MCF-7 在异位表达转录因子 Snail 后的基因表达谱芯片数据。该数据集以 GPL570 为检测平台，物种为人（9606），主题归类为表达谱芯片分析，本站将其归入肿瘤 / 乳腺癌分类。数据集包含 1 个文件，样例文件名为 GSE58252_series_matrix.txt.gz，作者为 Roman Mezencev，源站发布时间为 Jun 05 201。整体而言，该数据集围绕 Snail 转录因子在乳腺癌细胞中的表达效应展开，适合用于研究上皮—间质转化相关基因表达变化的科研人员参考使用。
【数据集背景】
源站描述指出，转录因子 Snail 被认为介导上皮—间质转化（EMT），并使上皮来源的癌细胞获得间质性的侵袭表型。该数据集正是围绕这一生物学问题设计，以乳腺癌细胞系 MCF-7 为对象，通过异位表达转录因子 Snail 来观察基因表达层面的变化。数据集标题明确表明其内容为“异位表达转录因子 Snail 的乳腺癌细胞系 MCF-7 的表达数据”，因此其研究背景聚焦于 Snail 与乳腺癌细胞表型转变之间的关系。
【数据内容】
该数据集属于表达谱芯片数据，主题标签为 Expression profiling by array，检测平台为 GPL570，物种标识为 9606（人）。数据集共包含 1 个文件，样例文件为 GSE58252_series_matrix.txt.gz，即系列矩阵文件，通常以压缩形式提供表达谱矩阵信息。本站分类将其归入肿瘤 / 乳腺癌方向。除上述信息外，源站未提供样本数量、分组设计、探针注释等更细的内容。
【采集与来源】
数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov（NCBI GEO），源站标题为“Expression data from breast cancer cell line MCF-7 with ectopic expression of the transcription factor Snail”。作者为 Roman Mezencev，源站发布时间为 Jun 05 201。数据通过芯片表达谱分析获得，平台为 GPL570。关于具体的实验操作流程、培养条件、RNA 提取与杂交细节，源站未提供。
【适用场景】
基于其主题与设计，该数据集可用于考察乳腺癌细胞系 MCF-7 在异位表达 Snail 后基因表达谱的变化，进而支持与上皮—间质转化、细胞侵袭表型相关的表达层面分析。适合作为乳腺癌细胞中转录因子调控研究的表达谱参考数据。关于该数据集在其他具体研究场景中的适用性，源站未提供。
【使用方法】
使用时可下载数据文件 GSE58252_series_matrix.txt.gz，按文件格式以 GZIP 压缩包方式读取。建议先在小样本上核对字段与编码，确认无误后再批量接入分析流程。关于矩阵文件内具体字段含义与注释信息，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集仅包含 1 个文件，样本规模与重复设计信息源站未提供；数据来自单一细胞系 MCF-7 的芯片表达谱，关于其批次信息、质控指标及标准化处理细节，源站未提供。使用时应注意结合平台注释与自身分析目的进行判断。
【引用与许可】
作者为 Roman Mezencev，来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。关于该数据集的引用方式与使用许可条款，源站未提供。
下载信息
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使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE58252
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
已有研究提出，转录因子Snail可介导上皮-间质转化（EMT），并使上皮性癌细胞获得间质侵袭表型。为分析异位Snail表达对上皮性乳腺癌细胞系的分子效应，本研究比较了转染过表达Snail-6SA变体的MCF-7细胞（MCF-7-Snail）与转染对照质粒的MCF-7细胞（MCF-7-control）的基因表达谱。上述细胞系的建立方法此前已由Zhou等报道（PMID: 15448698）。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册（NMPA/FDA）？
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连，提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。
