利用患者来源异种移植小鼠模型鉴定乳腺癌骨髓微转移相关基因

该数据集来自 NCBI GEO,标题为利用患者来源异种移植(PDX)小鼠模型鉴定乳腺癌骨髓微转移相关基因。研究将转移前乳腺癌患者的原发肿瘤移植建立 PDX 系统,发现远处器官转移与 PDX 小鼠骨髓中播散肿瘤细胞(BM DTCs)的存在相关,并对发生转移的荷瘤 PDX 小鼠骨髓与无瘤对照小鼠骨髓进行

geo
浏览 4
基因组分类Expression profiling by arrayGPL624410090
GSE57947: Identification of genes associated with breast cancer micrometastatic disease in bone marrow using a Patient Derived Xenograft mouse model

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-11-03

资源简介

利用患者来源异种移植小鼠模型鉴定乳腺癌骨髓微转移相关基因

Identification of genes associated with breast cancer micrometastatic disease in bone marrow using a Patient Derived Xenograft mouse model

该数据集来自 NCBI GEO,标题为利用患者来源异种移植(PDX)小鼠模型鉴定乳腺癌骨髓微转移相关基因。研究将转移前乳腺癌患者的原发肿瘤移植建立 PDX 系统,发现远处器官转移与 PDX 小鼠骨髓中播散肿瘤细胞(BM DTCs)的存在相关,并对发生转移的荷瘤 PDX 小鼠骨髓与无瘤对照小鼠骨髓进行了比较基因表达分析。数据包含 1 个文件 GSE57947_series_matrix.txt.gz,属于表达谱芯片数据,可用于探索乳腺癌骨髓微转移相关基因及转移机制研究(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:May 23 201。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):在本研究中,我们利用通过移植转移前乳腺癌患者原发肿瘤建立的患者来源异种移植(PDX)系统,证明远处器官转移的发生与 PDX 小鼠骨髓中播散肿瘤细胞(BM DTCs)的存在相关。我们对发生转移性疾病的荷瘤 PDX 小鼠骨髓(BM)与无瘤对照的骨髓进行了比较基因表达分析。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:Expression profiling by array、GPL6244、10090。本站分类:肿瘤/乳腺癌。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE57947

【使用注意】

· 源站最后修改于 Jul 26 201,引用时请注意版本时效。

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付,我们提供全链路闭环服务,让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持?联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

免费样本无法满足模型训练要求?千方提供经三甲医院脱敏、带病理回证与专家标注的商业级专病数据集。

使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE57947

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

在本研究中,我们利用通过移植转移前乳腺癌患者原发肿瘤建立的患者来源异种移植(PDX)系统,证明了远处器官转移的发生与PDX小鼠体内骨髓播散肿瘤细胞(BM DTCs)的存在相关。我们对发生转移性疾病的荷瘤PDX小鼠的骨髓(BM)与非荷瘤对照组的骨髓进行了比较基因表达分析。在此数据集中,分析包括了来自七只伴有转移性肿瘤的荷瘤小鼠的骨髓、两只对照小鼠的骨髓、一个原发肿瘤以及其中一只荷瘤小鼠的脾脏转移瘤。这项研究有助于识别与骨髓中存在的DTCs相关的新基因表达模式,并支持了骨髓中存在的DTCs经历上皮间质转化(EMT)的概念。基因阵列数据分析发现,与对照组动物的骨髓相比,PDX小鼠骨髓中显著高表达的多个基因,包括已知的癌基因(ETS1、GNL3)、转移调节因子(MALAT1、ALCAM、CD44)或与EMT相关的基因(SIP 1)。

需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?

公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。