早期乳腺癌切除后循环miRNA变化数据集

该数据集来自NCBI GEO(GSE57661),聚焦早期乳腺癌肿瘤切除前后循环miRNA水平的变化。研究对24例绝经后雌激素受体阳性早期乳腺癌患者手术前及术后3周的血清样本进行基于LNA的全局定量实时PCR分析,检测到142至161个miRNA,其中107个在所有样本中可检出

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其他预测Expression profiling by RT-PCRGPL186939606
GSE57661: Alterations in circulating miRNAs following early-stage breast cancer resection

基本信息

模态
其他
任务类型
预测
创建/更新时间
2026-10-17

资源简介

早期乳腺癌切除后循环miRNA变化数据集

Alterations in circulating miRNAs following early-stage breast cancer resection

该数据集来自NCBI GEO(GSE57661),聚焦早期乳腺癌肿瘤切除前后循环miRNA水平的变化。研究对24例绝经后雌激素受体阳性早期乳腺癌患者手术前及术后3周的血清样本进行基于LNA的全局定量实时PCR分析,检测到142至161个miRNA,其中107个在所有样本中可检出。数据可用于探索循环miRNA作为乳腺癌手术相关生物标志物的潜力,并支持差异表达与预测建模分析(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:May 14 201。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):引言:循环microRNA(miRNA)具有显著的稳定性,可能在多种临床癌症场景中作为生物标志物。本研究旨在探究乳腺癌手术后特定循环miRNA水平的变化,并评估这些变化是否在独立数据集中也能观察到。方法:采用基于LNA的全局定量实时PCR(qPCR)对24例绝经后雌激素受体阳性早期乳腺癌患者手术前及肿瘤切除后3周前瞻性收集的血清样本进行全局miRNA分析。结果:样本中检测到的特定miRNA数量范围为142至161,其中107个miRNA在所有样本中均可检出。经多重比较校正后,3个循环miRNA(miR-338-3p、miR-223和miR-148a)表现出显著降低,以及1个miRNA

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:Expression profiling by RT-PCR、GPL18693、9606。本站分类:肿瘤/乳腺癌。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE57661

【使用注意】

· 源站最后修改于 Jan 30 202,引用时请注意版本时效。

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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

引言:循环microRNA(miRNA)表现出显著的稳定性,可能在多种临床癌症情境中作为生物标志物。本研究旨在探讨乳腺癌手术后特定循环miRNA水平的变化,并评估这些变化是否在一个独立数据集中也能观察到。方法:采用基于LNA的全局定量实时PCR(qPCR)对24例雌激素受体阳性早期乳腺癌绝经后女性术前及肿瘤切除术后3周前瞻性收集的血清样本进行全局miRNA分析。结果:样本中检测到的特定miRNA数量范围为142至161个,其中107个miRNA在所有样本中均可检测到。经多重比较校正后,3个循环miRNA(miR-338-3p、miR-223和miR-148a)在术后样本中的水平显著低于术前样本,1个miRNA(miR-107)在术后样本中的水平高于术前样本(p<0.05)。与术前样本相比,术后样本中未出现持续无法检测到的miRNA。

随后,我们将研究发现与一个来自相似患者群体的数据集进行了比较,该数据集采用相似的研究设计和相同的qPCR分析平台进行分析,结果一致性有限。结论:在绝经后女性原发性ER+乳腺癌根治性切除术后,一组4种循环miRNA的水平显著改变。这些特定的miRNA可能参与肿瘤发生,并有可能用于监测手术是否已切除所有癌细胞和/或随后患者是否出现复发。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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