妊娠期人类乳腺癌基因表达谱数据集
该数据集来自 NCBI GEO，包含妊娠期人类乳腺癌的基因表达谱数据，涉及 54 例妊娠期与 113 例年龄和分期匹配的非妊娠期乳腺癌患者，并附有完整临床与生存数据
基本信息
资源简介
妊娠期人类乳腺癌基因表达谱数据集
Gene expression profiling of human breast cancer during pregnancy
该数据集来自 NCBI GEO，包含妊娠期人类乳腺癌的基因表达谱数据，涉及 54 例妊娠期与 113 例年龄和分期匹配的非妊娠期乳腺癌患者，并附有完整临床与生存数据。数据可用于比较妊娠期与非妊娠期乳腺癌的转录组差异、评估体细胞热点突变模式、基于 PAM50 与 3-Gene 分类器划分分子亚型、开展 GSEA 通路富集分析，以及探索与无病生存相关的基因表达（来源 NCBI）。
【数据集背景】
源站首次发布：Dec 05 201。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：使用包含 54 例妊娠期和 113 例年龄/分期匹配的非妊娠期乳腺癌患者且具有完整临床与生存数据的数据集；我们分别使用 Sequenom® 和 Affymetrix® 评估了热点体细胞突变模式并进行了转录组分析。乳腺癌分子亚型使用 PAM50 和 3-Gene 分类器定义。我们进行了基因集富集分析（GSEA）以评估与妊娠期诊断相关的通路。我们根据妊娠状态研究了癌症相关基因和已发表基因集的差异表达。我们最后研究了与无病生存相关的基因。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个，合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签：Expression profiling by array、GPL13667、9606。本站分类：肿瘤/乳腺癌。
【获取与许可】
源站页面：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE53031
【使用注意】
· 源站最后修改于 Mar 21 201，引用时请注意版本时效。
下载信息
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源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE53031
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
我们使用了一个数据集，包含54名怀孕和113名年龄/分期匹配的非怀孕乳腺癌患者，这些患者具有完整的临床和生存数据；我们分别使用Sequenom®和Affymetrix®评估了热点体细胞突变模式并进行了转录组分析。乳腺癌分子亚型使用PAM50和3基因分类器定义。我们进行了基因集富集分析（GSEA），以评估与妊娠期诊断相关的通路。我们根据妊娠情况研究了癌症相关基因和已发表基因集的差异表达。最后，我们研究了与无病生存相关的基因。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册（NMPA/FDA）？
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连，提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。
