原发性和继发性血管肉瘤的全基因组分析
该数据集来自 NCBI，标题为原发性和继发性血管肉瘤的全基因组分析，使用福尔马林固定石蜡包埋样本提取的 RNA 进行表达谱检测
基本信息
资源简介
原发性和继发性血管肉瘤的全基因组分析
Genome-wide analysis of primary and secondary angiosarcomas using RNA extracted from formalin-fixed parafinembedded samples.
该数据集来自 NCBI，标题为原发性和继发性血管肉瘤的全基因组分析，使用福尔马林固定石蜡包埋样本提取的 RNA 进行表达谱检测。源站描述指出血管肉瘤为高度恶性肿瘤，可分为病因不明的原发性和常继发于乳腺癌放疗后的继发性两类，两者形态学难以区分，因此研究旨在识别可用于诊断和治疗的遗传分类器。数据集含 1 个文件，样例为 GSE52664_series_matrix.txt.gz，作者为 Emelie Styring，发布时间为 Nov 22 201，主题标签涉及表达谱芯片、GPL14951 和 9606（来源 NCBI）。
【数据集背景】
源站首次发布：Nov 22 201。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：血管肉瘤是高度恶性的肿瘤，可作为病因不明的原发性血管肉瘤发生，或作为继发性血管肉瘤发生，后者最常继发于乳腺癌的放射治疗之后。这些亚型在形态学上无法区分，这促使我们旨在识别用于诊断和治疗应用的遗传分类器。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个，合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签：Expression profiling by array、GPL14951、9606。本站分类：肿瘤/乳腺癌。
【获取与许可】
源站页面：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE52664
【使用注意】
· 源站最后修改于 Dec 22 201，引用时请注意版本时效。
下载信息
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源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE52664
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
血管肉瘤是高度恶性的肿瘤，可作为病因不明的原发性血管肉瘤发生，或作为继发性血管肉瘤发生，后者最常见于乳腺癌放射治疗后。这些亚型在形态学上无法区分，这促使我们旨在识别用于诊断和治疗应用的遗传分类器。我们应用18k全基因组c-DNA介导的退火、选择、延伸和连接（WG-DASL）检测对26例原发性和29例继发性血管肉瘤进行表达谱分析。原发性和继发性血管肉瘤之间有103个显著失调基因的差异，继发性血管肉瘤中RET、KIT、FLT4、MYC和RASGRP3上调，CDKN2C下调。功能注释分析表明多个靶基因参与受体蛋白酪氨酸激酶通路。RET上调和CDKN2C下调是继发性血管肉瘤的特征，这为评估RET激酶抑制剂治疗这些高度侵袭性肿瘤提供了机制基础。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册（NMPA/FDA）？
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连，提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。
