汉堡系列乳腺癌基因表达数据

资源简介

汉堡系列乳腺癌基因表达数据

GSE46184（Breast Cancer Gene Expression Data from Hamburg Series）是一份来自汉堡系列的乳腺癌基因表达数据集，收录了74例不同亚型乳腺癌患者手术活检样本的基因表达谱。该数据集通过芯片表达谱技术获取，所用平台为GPL96，物种为人（9606），属于肿瘤／乳腺癌分类下的表达谱数据资源，来源于 ncbi.nlm.nih.gov。数据集以单个文件形式提供，文件样例为 GSE46184_series_matrix.txt.gz，便于研究者下载后直接用于转录组层面的探索性分析。整体而言，该数据集围绕乳腺癌不同亚型的基因表达特征展开，适合作为乳腺癌分子分型、差异表达及亚型间比较研究的公开数据来源之一，为相关方法验证与二次分析提供了可获取的样本级表达信息。

【数据集背景】

该数据集源自汉堡系列乳腺癌样本的基因表达研究，其源站标题为“Breast Cancer Gene Expression Data from Hamburg Series”。研究关注的是不同亚型乳腺癌患者手术活检样本的基因表达特征，作者为 Thomas、Karn，发布时间为 Apr 18 201。数据集被归入肿瘤／乳腺癌分类，主题标签包括 Expression profiling by array、GPL96 与 9606，分别指向芯片表达谱技术、所用芯片平台以及人类物种。该数据集为研究者了解乳腺癌不同亚型在转录水平上的差异提供了一个公开可查的数据集合。

【数据内容】

数据集包含74例不同亚型乳腺癌患者手术活检样本的基因表达谱，数据以芯片表达谱形式呈现，平台为 GPL96，物种为人（9606）。文件数量为1，文件样例为 GSE46184_series_matrix.txt.gz，即经过压缩的表达谱矩阵文件。该文件通常承载样本层面的表达信息，可供后续读取与整理。源站未提供关于样本临床信息、分组细节及具体基因数量的进一步说明。

【采集与来源】

数据来自乳腺癌患者的手术活检样本，采集对象为74例不同亚型的乳腺癌患者，属于汉堡系列。数据来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，作者为 Thomas、Karn，发布时间为 Apr 18 201。数据通过芯片表达谱技术获取，平台标注为 GPL96。除上述信息外，源站未提供样本采集流程、伦理审批及处理步骤的更多细节。

【适用场景】

该数据集适用于乳腺癌基因表达层面的探索性研究，例如不同亚型之间的表达谱比较、差异表达分析的复现与方法验证，以及芯片表达数据的处理流程练习。由于数据覆盖74例不同亚型样本，也可用于亚型相关特征的初步观察。具体研究用途需结合使用者自身分析设计与数据实际情况确定，源站未提供针对特定应用场景的说明。

【使用方法】

使用时可先下载数据文件 GSE46184_series_matrix.txt.gz，该文件为 GZIP 压缩包格式，需按对应格式解压与读取。建议先在小样本上核对字段与编码，确认无误后再批量接入，以避免因格式或编码问题导致分析偏差。读取后可结合芯片平台 GPL96 的注释信息对表达数据进行解读。源站未提供更详细的分析流程或代码示例。

【质量与限制】

数据集为公开来源的芯片表达谱数据，样本量为74例，文件数量为1。源站未提供关于数据质量控制、缺失值处理、批次效应及验证结果的说明，使用者在分析时需自行评估数据适用性。此外，源站未提供样本临床特征与亚型划分的具体依据，相关结论的推广需谨慎。

【引用与许可】

作者为 Thomas、Karn，发布时间为 Apr 18 201。源站未提供许可条款与具体引用格式，使用与再分发前应向来源站 ncbi.nlm.nih.gov 核实相关要求。