乳腺癌转移中癌症干细胞与非癌症干细胞间转变数据集

数据基于四个原位乳腺癌小鼠模型(CSC-alone、nCSC-alone、bilateral CSC/nCSC、mixed CSC/nCSC),结合单细胞RNA测序与免疫荧光分析,研究转移过程中癌症干细胞与非癌症干细胞的双向表型互变

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基因组分类GPL246769606
GSE349626: Transitions between cancer stem cells and non-cancer stem cells during metastasis

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-17

资源简介

乳腺癌转移中癌症干细胞与非癌症干细胞间转变数据集

Transitions between cancer stem cells and non-cancer stem cells during metastasis

该数据集来自 ncbi.nlm.nih.gov,标题为“Transitions between cancer stem cells and non-cancer stem cells during metastasis”,属于肿瘤/乳腺癌分类。数据基于四个原位乳腺癌小鼠模型(CSC-alone、nCSC-alone、bilateral CSC/nCSC、mixed CSC/nCSC),结合单细胞RNA测序与免疫荧光分析,研究转移过程中癌症干细胞与非癌症干细胞的双向表型互变。文件为 GSE349626_series_matrix.txt.gz,可用于表达谱分析与干细胞状态分类研究(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Oct 05 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):癌症干细胞(CSCs)与非癌症干细胞(nCSCs)在转移过程中表现出动态的双向转变,然而这种相互转化的机制及治疗意义仍知之甚少。为研究这些转变及其治疗相关性,我们利用稳定谱系标记建立了四种原位乳腺癌小鼠模型:单独CSC、单独nCSC、双侧CSC/nCSC以及混合CSC/nCSC肿瘤。单细胞RNA测序和免疫荧光分析支持在肿瘤进展和转移过程中,CSC和nCSC来源的群体之间存在双向表型互变,nCSC在原发肿瘤和转移灶中均获得CD24-high的CSC样状态,而CSC则呈现EGFR-high的nCSC样表型。使用ATG-031靶向CD24或使用osimertinib靶向EGFR的单一疗法仅能部分抑制肿瘤生长和

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL24676、9606。本站分类:肿瘤/乳腺癌。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE349626

【使用注意】

· 源站最后修改于 Oct 14 202,引用时请注意版本时效。

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源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE349626

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

癌症干细胞(CSCs)与非癌症干细胞(nCSCs)在转移过程中表现出动态的双向转换,然而这种相互转化的机制及其治疗意义仍知之甚少。为研究这些转换及其治疗相关性,我们利用稳定的谱系标记建立了四种原位乳腺癌小鼠模型:单纯CSC、单纯nCSC、双侧CSC/nCSC以及混合CSC/nCSC肿瘤。单细胞RNA测序和免疫荧光分析支持在肿瘤进展和转移过程中,CSC来源和nCSC来源的细胞群体之间存在双向表型互变,其中nCSCs获得CD24高表达的CSC样状态,而CSCs在原发肿瘤和转移灶中均呈现EGFR高表达的nCSC样表型。以ATG-031靶向CD24或以奥希替尼靶向EGFR的单药治疗仅能部分抑制肿瘤生长和转移,这与细胞可塑性可能为靶向单一状态提供逃逸途径的可能性相一致。联合靶向CD24和EGFR在双侧和混合肿瘤模型中均能更有效地抑制肿瘤进展和转移负荷。

总体而言,这些发现表明,在乳腺癌进展过程中,CSC与nCSC状态之间的双向相互转化是动态耦合的,并提示同时靶向这两种细胞状态可能为限制肿瘤可塑性和转移提供更有效的策略。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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