GSE343484：三阴性乳腺癌细胞通过TRPV1激活感觉神经元驱动神经突生长与肿瘤进展

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE343484

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
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数据说明

三阴性乳腺癌（TNBC）的肿瘤微环境以感觉神经密度增加为特征，这种增加通过促进迁移和转移推动癌症进展。然而，支配肿瘤的神经来源以及驱动感觉神经支配进入肿瘤的机制仍知之甚少。利用体内逆行标记技术，我们发现乳腺肿瘤伴有源自背根神经节的神经增多。我们发现，乳腺肿瘤细胞的存在导致体内背根神经节和体外培养的感觉神经元中基因表达发生显著变化，这些变化与生长、再生、兴奋性和损伤相关。我们发现，TNBC细胞触发应激和活化标志物，并以瞬时受体电位香草酸亚型1（TRPV1）依赖的方式诱导神经元放电。在2D和3D细胞培养模型中，TNBC细胞均促进感觉神经生长，而Trpv1敲除可消除这一现象。我们将c-Jun和IL-6鉴定为神经突生长的效应因子，其作用于TRPV1下游，在体外促进神经突生长。最后，在Trpv1敲除小鼠中，TNBC肿瘤表现出生长延迟和肺转移减少。这些发现提示TRPV1在肿瘤-神经串扰中具有关键作用，为减少转移性疾病提供了一个潜在靶点。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。