SRPK2 CLIP-seq 揭示乳腺癌细胞中直接 RNA 靶点
SRPK2 是一种丝氨酸/精氨酸富集蛋白特异性激酶，可磷酸化剪接因子并调控可变剪接，在乳腺癌中高表达且与不良预后相关。为鉴定乳腺癌细胞中 SRPK2 直接结合的 RNA，研究者对 MDA-MB-231 细胞进行了 SRPK2 的 UV 交联 iRIP-seq
基本信息
资源简介
SRPK2 CLIP-seq 揭示乳腺癌细胞中直接 RNA 靶点
SRPK2 CLIP-seq reveals direct RNA targets in breast cancer cells
该数据集来自 NCBI，标题为 SRPK2 CLIP-seq reveals direct RNA targets in breast cancer cells，属于肿瘤/乳腺癌分类。SRPK2 是一种丝氨酸/精氨酸富集蛋白特异性激酶，可磷酸化剪接因子并调控可变剪接，在乳腺癌中高表达且与不良预后相关。为鉴定乳腺癌细胞中 SRPK2 直接结合的 RNA，研究者对 MDA-MB-231 细胞进行了 SRPK2 的 UV 交联 iRIP-seq。数据集含 1 个文件，样例为 GSE338304_series_matrix.txt.gz，可用于分析 SRPK2 的 RNA 结合靶点（来源 NCBI）。
【数据集背景】
源站首次发布：Jul 10 202。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：SRPK2（SRSF protein kinase 2）是一种丝氨酸/精氨酸富集蛋白特异性激酶，可磷酸化剪接因子并调控可变剪接。SRPK2 在乳腺癌中高表达且与不良预后相关，并已被认为参与 FASN mRNA 的转录后调控。为鉴定乳腺癌细胞中 SRPK2 直接结合的 RNA，我们对 MDA-MB-231 细胞进行了 SRPK2 的 UV 交联 iRIP-seq。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个，合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签：Other、GPL34284、9606。本站分类：肿瘤/乳腺癌。
【获取与许可】
源站页面：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE338304
【使用注意】
· 源站最后修改于 Jul 15 202，引用时请注意版本时效。
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pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
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- OpenDataLab:
数据说明
SRPK2（SRSF蛋白激酶2）是一种富含丝氨酸/精氨酸蛋白特异性激酶，可磷酸化剪接因子并调控可变剪接。SRPK2在乳腺癌中高表达，与不良预后相关，并已被认为参与FASN mRNA的转录后调控。为鉴定乳腺癌细胞中SRPK2直接结合的RNA，我们在MDA-MB-231细胞中对SRPK2进行了紫外交联iRIP-seq。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册（NMPA/FDA）？
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连，提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。
