MDA-MB-231细胞中cGAS与JunB重叠转录靶点

该数据集来自NCBI GEO,收录MDA-MB-231乳腺癌细胞中cGAS与JunB重叠转录靶点的表达谱数据。研究背景为cGAS除作为胞质dsDNA感受器外,还可在染色质上不依赖核小体结合参与转录调控,并由AP-1因子如JunB招募至染色质

geo
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基因组分类GPL342849606
GSE337117: Overlapped transcription targets of cGAS and JunB in MDA-MB-231 cells

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-11-03

资源简介

MDA-MB-231细胞中cGAS与JunB重叠转录靶点

Overlapped transcription targets of cGAS and JunB in MDA-MB-231 cells

该数据集来自NCBI GEO,收录MDA-MB-231乳腺癌细胞中cGAS与JunB重叠转录靶点的表达谱数据。研究背景为cGAS除作为胞质dsDNA感受器外,还可在染色质上不依赖核小体结合参与转录调控,并由AP-1因子如JunB招募至染色质。数据包含1个文件,采用高通量测序进行表达谱分析,物种为人(9606),平台为GPL34284。可用于识别cGAS与JunB共同调控的转录靶点,研究其在乳腺癌细胞中的转录调控机制(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Jun 30 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):除作为胞质dsDNA感受器外,我们发现cGAS还参与染色质上不依赖核小体结合的转录控制。cGAS由AP-1因子(如JunB)招募至染色质。本分析的目标是确定MDA-MB-231细胞中由cGAS和JunB共同调控的常见转录靶点。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL34284、9606。本站分类:肿瘤/乳腺癌。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE337117

【使用注意】

· 源站最后修改于 Jul 12 202,引用时请注意版本时效。

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

除了作为胞质dsDNA传感器外,我们发现cGAS还独立于核小体结合参与染色质上的转录调控。cGAS通过AP-1因子如JunB被招募到染色质上。本分析旨在确定MDA-MB-231细胞中由cGAS和JunB共同调控的常见转录靶标。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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