靶向ERO1α在三阴性乳腺癌中触发肿瘤免疫监视 [scRNA-seq]

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE336881

标准获取流程：

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3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

三阴性乳腺癌（TNBC）仍是一种高度侵袭性的恶性肿瘤，对免疫检查点阻断的应答有限。在此，我们鉴定出内质网氧化还原酶1α（ERO1α）——氧化性蛋白折叠的关键调控因子——是TNBC肿瘤免疫原性及免疫治疗应答的决定因素。无偏蛋白质组学分析表明，ERO1α缺失重塑了TNBC糖蛋白组，导致与先天免疫信号相关的通路富集。尽管ERO1α缺失不影响肿瘤细胞生长，但其重塑了免疫肿瘤微环境，增强了抗原呈递，改变了髓系细胞组成，并调控了PD-1/PD-L1相关信号。在功能上，ERO1α缺失使原本难治的TNBC肿瘤对PD-1阻断敏感，在免疫功能健全的宿主中导致持久的肿瘤消退。相反，骨髓来源免疫细胞中ERO1α缺失对肿瘤生长或治疗应答影响极小，支持ERO1α的肿瘤内在机制。使用新型小分子抑制剂I29对ERO1α进行药理学抑制，可模拟ERO1α基因缺失的表型，并增强抗PD-1治疗的疗效。

总之，这些发现表明，ERO1α依赖的糖蛋白组重塑是三阴性乳腺癌中抗肿瘤免疫的调节因子，也是免疫检查点反应性的一种具有治疗可操作性的机制。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。