CDK7抑制通过抑制Hippo-YAP信号逆转HR+乳腺癌CDK4/6抑制剂耐药 [ChIP-seq]

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE335518

标准获取流程：

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数据说明

激素受体阳性（HR+）乳腺癌是最常见的乳腺癌亚型，而细胞周期蛋白依赖性激酶4/6抑制剂（CDK4/6i）是转移性疾病的主要治疗手段。CDK6的扩增或过表达是CDK4/6i耐药的已知驱动因素，目前尚无针对性的治疗策略。通过激酶抑制剂筛选抑制CDK6的化合物，我们鉴定出PIK-75作为一种能够下调CDK6并逆转HR+乳腺癌中CDK4/6i耐药的药物。我们发现PIK-75作为CDK7抑制剂发挥作用，可消除RNA聚合酶II（Pol II）羧基末端结构域丝氨酸5的磷酸化。结构不同的CDK7抑制剂THZ1和shRNA介导的CDK7敲低均重现了对yes相关蛋白（YAP）和CDK6的抑制，证实该效应依赖于CDK7。染色质免疫沉淀实验表明，CDK7抑制减少了YAP1启动子上Pol II-丝氨酸5的占据，从而下调YAP1转录和YAP-TEAD输出。

全基因组范围内，PIK-75诱导了启动子近端Pol II暂停，这一现象在致癌通路基因中更为显著；转录组和蛋白质组分析证实了真正的CDK7抑制特征，伴随广泛的内含子保留，而非以磷酸肌醇3-激酶为主的反应。在过表达CDK6的异种移植瘤中，PIK-75联合abemaciclib逆转了耐药性，并在体内抑制了YAP和CDK6。这些发现界定了一条连接CDK7和Pol II丝氨酸5磷酸化与Hippo-YAP信号通路及CDK6的转录轴，并确立了CDK7抑制作为CDK4/6i耐药HR+乳腺癌的合理策略，支持对临床阶段CDK7抑制剂与持续CDK4/6抑制联合应用的评估。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。