妊娠相关三阴性乳腺癌风险机制的空间组学数据集
该数据集为NCBI GEO上的SuperSeries,标题聚焦妊娠相关三阴性乳腺癌风险机制的空间组学解析,由David、Eugene、Frankhouser提交,发布时间为Jun 12 202(源站未提供完整年份)

基本信息
资源简介
妊娠相关三阴性乳腺癌风险机制的空间组学数据集
GSE335336 是 NCBI GEO 上的一个 SuperSeries,标题为“Mechanisms of risk in pregnancy-associated triple negative breast cancer: insights from spatial omics”,聚焦妊娠相关三阴性乳腺癌风险机制的空间组学解析。该数据集归入肿瘤 / 乳腺癌分类,由 David、Eugene、Frankhouser 提交,发布时间为 Jun 12 202(源站未提供完整年份)。数据集包含 1 个文件,样例文件为 GSE335336_series_matrix.txt.gz,主题标签涉及 Other、GPL30173 与 9606。作为 SuperSeries,其源站描述说明它由下方列出的若干 SubSeries 组成,适合作为相关空间组学研究数据的入口进行检索与获取。
【数据集背景】
该数据集围绕妊娠相关三阴性乳腺癌的风险机制展开,标题明确指向空间组学(spatial omics)视角下的机制解析。三阴性乳腺癌是乳腺癌中缺乏常见受体表达的亚型,妊娠相关情形则涉及孕期或产后特殊生理背景下的风险评估问题;空间组学方法通常用于在组织原位考察分子特征的空间分布。以上为领域背景说明,该数据集的具体研究结论、样本构成与机制发现源站未提供。数据集在 GEO 中以 SuperSeries 形式组织,意味着它汇集了若干子系列,便于围绕同一研究主题集中访问。
【数据内容】
数据集包含 1 个文件,样例文件名为 GSE335336_series_matrix.txt.gz,属于 GZIP 压缩格式。系列矩阵文件通常以表格形式组织样本与特征信息,但该数据集矩阵中的具体字段、样本数量、平台注释细节及子系列清单源站未提供。主题标签中的 GPL30173 指向所使用的 GEO 平台编号,9606 对应人类物种标识,Other 为标签类别之一。由于是 SuperSeries,实际数据可能分布在所列 SubSeries 中,各子系列的数据类型与文件构成源站未提供。
【采集与来源】
数据来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,即 NCBI GEO 数据库。提交者为 David、Eugene、Frankhouser,发布时间为 Jun 12 202(源站未提供完整年份)。源站描述仅说明该 SuperSeries 由下方列出的 SubSeries 组成,未提供样本采集地点、采集时间、伦理审批信息、实验平台细节或数据处理流程。数据分类归入肿瘤 / 乳腺癌,主题标签包括 Other、GPL30173 与 9606。
【适用场景】
该数据集适用于妊娠相关三阴性乳腺癌风险机制的空间组学研究场景,可作为检索和获取相关子系列数据的入口。由于采用 SuperSeries 组织方式,适合需要沿研究主题汇总多个子系列的用户。具体可支持的分析类型、可回答的生物学问题以及是否适合作为验证集或对照数据,源站未提供,使用前应结合子系列内容自行判断。
【使用方法】
使用时可下载数据文件 GSE335336_series_matrix.txt.gz,按 GZIP 压缩包格式读取。建议先在小样本上核对字段与编码,确认无误后再批量接入。对于 SuperSeries,还应进一步查看其下方列出的 SubSeries,以获取实际的分析数据与配套文件;各子系列的文件格式与读取方式源站未提供。读取系列矩阵时应注意表头行与样本注释行的解析方式,避免将注释行误作数据行处理。
【质量与限制】
该数据集为 GEO 上的 SuperSeries,源站描述简短,未提供样本量、数据完整性、质控指标、批次信息或缺失值情况,因此无法据此评估数据质量。发布时间中的年份不完整(Jun 12 202),可能影响时间线判断。文件数量为 1,但 SuperSeries 的实际数据可能位于子系列中,仅凭该文件未必能覆盖全部研究内容。主题标签信息有限,平台 GPL30173 的具体注释内容源站未提供。使用时应以源站页面及子系列记录为准。
【引用与许可】
引用该数据集时应参考 NCBI GEO 源站页面提供的引用信息,提交者为 David、Eugene、Frankhouser。数据许可条款、使用限制及是否允许再分发源站未提供,使用前应查阅 GEO 相关使用政策与源站说明。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE335336
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
This SuperSeries is composed of the SubSeries listed below.
需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。




