妊娠相关三阴性乳腺癌风险机制空间组学数据集

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE335330

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

妊娠相关三阴性乳腺癌（PA-TNBC）是一种高度侵袭性、难以治疗的恶性肿瘤，其风险增加与哺乳后乳腺退化有关。为理解这一现象，我们使用GeoMx数字空间分析仪分析了来自33名女性（10例退化前/PRE；23例退化后/POST，均在分娩后3年内确诊）的46份未经治疗的PA-TNBC组织的转录景观，重点关注上皮和微环境变化。我们的研究结果显示，PRE与POST之间最显著的转录差异存在于非浸润性上皮中以及向浸润过渡期间。POST非浸润性上皮表现出炎症和发育通路的明显激活，而向TNBC过渡则涉及染色质重塑和迁移的升高。值得注意的是，POST浸润性上皮周围的肿瘤微环境（TME）表现出最大的免疫细胞浸润，但免疫耗竭也增加。伪时间分析强调产后1–2年窗口期具有最强的炎症信号传导。

这些结果强调了在看似正常的复旧后组织中进行早期分子检测的必要性，并提示靶向肿瘤微环境是治疗产后相关三阴性乳腺癌的一种可行策略。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。