野生型与Padi4缺陷小鼠肺来源三阴性乳腺癌细胞转录组分析

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE333273

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

转移复发仍是三阴性乳腺癌（TNBC）面临的主要难题。已知肺微环境中的中性粒细胞胞外诱捕网（NETs）在TNBC的转移定植和生长中发挥关键作用。然而，NETs在急性复发期间决定播散性肿瘤细胞（DTCs）表型可塑性及再激活中的确切作用仍不清楚。本研究利用原位急性复发转移小鼠模型，将4T1细胞移植到野生型或NET缺陷型（Padi4-/-）小鼠中，随后切除原发肿瘤。尽管Padi4缺陷对原发肿瘤的生长没有影响，但显著减少了肺转移并延长了生存期。从野生型小鼠中重新建立的肺源性4T1细胞表现出高度增殖的上皮表型，而从Padi4-/-小鼠中获得的细胞似乎维持静息的间充质状态。至关重要的是，组织适应的NET形成性肺中性粒细胞可通过强烈上调转化生长因子-β（TGF-β）负调控因子，从而减弱自分泌信号，诱导间充质-上皮转化（MET）样转换。

总体而言，我们的研究结果揭示，组织适应的NETs充当关键的肿瘤自主分子开关，协调退出静息状态并驱动转移性生长，突显了其作为TNBC围手术期治疗靶点的前景。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。