人类序贯淋巴结转移中免疫细胞动态的时空图谱

该数据集来自NCBI GEO,聚焦治疗初治三阴性乳腺癌(TNBC)患者,系统刻画原发肿瘤、前哨肿瘤引流淋巴结(S-TDLNs)与次级腋窝淋巴结(ALNs)中免疫细胞的动态变化

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基因组分类OtherGPL337629606
GSE328422: Spatio-temporal mapping of immune cell dynamics during human sequential lymph node metastasis

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-11-03

资源简介

人类序贯淋巴结转移中免疫细胞动态的时空图谱

Spatio-temporal mapping of immune cell dynamics during human sequential lymph node metastasis

该数据集来自NCBI GEO,聚焦治疗初治三阴性乳腺癌(TNBC)患者,系统刻画原发肿瘤、前哨肿瘤引流淋巴结(S-TDLNs)与次级腋窝淋巴结(ALNs)中免疫细胞的动态变化。研究整合影像质谱流式、单细胞RNA测序、Visium与Xenium空间转录组学及多重免疫荧光等多组学方法,并对覆盖不同转移阶段的FFPE淋巴结切片进行Xenium分析,以解析序贯淋巴结转移过程中的高分辨率空间组织、邻域复杂性与免疫细胞共定位。数据可用于研究淋巴结转移微环境与抗肿瘤免疫的空间特征(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Apr 17 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):区域淋巴结转移对远处转移进展、抗肿瘤免疫和患者预后具有关键影响。本研究使用整合多组学方法,包括影像质谱流式、单细胞RNA测序、Visium和Xenium空间转录组学以及多重免疫荧光,系统刻画了治疗初治三阴性乳腺癌(TNBC)患者配对的原始肿瘤、前哨肿瘤引流淋巴结(S-TDLNs)和次级腋窝淋巴结(ALNs)中的免疫细胞动态。对覆盖不同转移阶段的FFPE淋巴结切片进行了Xenium分析,以解析序贯淋巴结转移过程中的高分辨率空间组织、邻域复杂性和免疫细胞共定位。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:Other、GPL33762、9606。本站分类:肿瘤/乳腺癌。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE328422

【使用注意】

· 源站最后修改于 Jun 29 202,引用时请注意版本时效。

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    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

区域淋巴结转移对远处转移进展、抗肿瘤免疫及患者预后具有关键影响。本研究采用整合多组学方法,包括成像质谱流式、单细胞RNA测序、Visium和Xenium空间转录组学以及多重免疫荧光,系统表征了未经治疗的三阴性乳腺癌(TNBC)患者配对原发肿瘤、前哨肿瘤引流淋巴结(S-TDLNs)和次级腋窝淋巴结(ALNs)中的免疫细胞动态变化。对涵盖不同转移阶段的FFPE淋巴结切片进行了Xenium分析,以解析序贯性淋巴结转移过程中的高分辨率空间组织、邻域复杂性及免疫细胞共定位。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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