T47D 细胞系 DNase-seq 数据（ENCSR798KFF）

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T47D 细胞系 DNase-seq 数据（ENCSR798KFF）

GSE321300 是一个基于高通量测序的基因组结合与占据位点分析数据集，英文全称为 DNase-seq from T47D（ENCSR798KFF），来源于 NCBI，本站将其归类于肿瘤 / 乳腺癌方向。该数据集围绕 T47D 细胞开展 DNase-seq 实验，用于在全基因组范围内识别染色质开放区域及基因组结合或占据位点，适合乳腺癌相关转录调控、染色质可及性以及顺式调控元件的研究。数据集包含 1 个文件，样例文件为 GSE321300_series_matrix.txt.gz，由 ENCODE 与 DCC 提供，发布时间为 Feb 27 202，主题标签涵盖 Genome binding/occupancy profiling by high throughput sequencing、GPL16791 与 9606。

【数据集背景】

该数据集来自 NCBI，标题为 DNase-seq from T47D（ENCSR798KFF），属于 ENCODE 项目相关产出，作者标注为 ENCODE 与 DCC。本站分类将其归入肿瘤 / 乳腺癌，说明其研究对象 T47D 与乳腺癌研究背景相关。DNase-seq 是一种通过高通量测序检测染色质开放区域的方法，可用于刻画基因组中调控元件所在的位置。该数据集的主题标签包括 Genome binding/occupancy profiling by high throughput sequencing、GPL16791 与 9606，分别指向高通量测序类的基因组结合与占据分析、平台或样本相关编号以及人类物种标识。

【数据内容】

数据集包含 1 个文件，样例文件名为 GSE321300_series_matrix.txt.gz。该文件以 GZIP 压缩包形式提供。从源站标题与主题标签可知，数据内容属于 DNase-seq 实验产生的基因组结合与占据位点分析结果，可用于全基因组染色质开放区域及基因组结合或占据位点的研究。除上述文件信息外，源站未提供更细的字段结构、样本数量、测序深度或具体数据表内容。

【采集与来源】

数据来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，源站标题为 DNase-seq from T47D（ENCSR798KFF）。作者为 ENCODE 与 DCC，发布时间为 Feb 27 202。数据集英文名为 GSE321300: DNase-seq from T47D (ENCSR798KFF)。关于实验的具体采集流程、建库方式、测序平台细节及样本处理步骤，源站未提供。

【适用场景】

根据侧写线索，该数据基于高通量测序，用于全基因组染色质开放区域及基因组结合/占据位点分析，适用于乳腺癌相关转录调控、染色质可及性及顺式调控元件研究。因此，该数据集可用于探索 T47D 细胞中染色质开放状态与调控元件分布，辅助理解乳腺癌背景下的转录调控机制。除上述方向外，源站未提供其他具体适用场景。

【使用方法】

使用时可下载数据文件 GSE321300_series_matrix.txt.gz，按文件格式读取，即 GZIP 压缩包。建议先在小样本上核对字段与编码，确认无误后再批量接入。关于更详细的读取参数、分析流程或软件要求，源站未提供。

【质量与限制】

源站未提供关于数据质量、覆盖度、重复性、批次效应或技术限制的具体说明。数据集仅包含 1 个文件，文件样例为 GSE321300_series_matrix.txt.gz。除文件数量与格式外，源站未提供其他质量评估信息。

【引用与许可】

源站描述指出，关于数据使用条款与条件，请参考 http://www.genome.gov/27528022 以及 http://www.genome.gov/Pages/Research/ENCODE/ENCODE_Data_Use_Policy_for_External_Users_03-07-14.pdf。除上述许可与使用条款指引外，源站未提供其他引用要求或授权说明。