T47D 细胞的 DNase-seq 数据（ENCSR175CXB）

资源简介

T47D 细胞的 DNase-seq 数据（ENCSR175CXB）

GSE321046 是一个以 DNase-seq 为技术手段、以 T47D 乳腺癌细胞为研究对象的高通量测序数据集，编号为 ENCSR175CXB。该数据集由 ENCODE 项目的数据协调中心（DCC）提交，来源站为 NCBI，本站将其归类于肿瘤 / 乳腺癌方向。数据集包含 1 个文件，样例文件名为 GSE321046_series_matrix.txt.gz，发布时间为 Feb 26 202。整体而言，该数据集属于基因组结合/占据谱分析类数据，可用于研究 T47D 细胞中染色质开放区域及调控元件分布情况，是乳腺癌相关功能基因组学研究的一项公开数据资源。

【数据集背景】

该数据集来自 ENCODE 项目，编号 ENCSR175CXB，标题为“DNase-seq from T47D (ENCSR175CXB)”。DNase-seq 是一种利用脱氧核糖核酸酶 I 对染色质进行切割、从而识别基因组中开放染色质区域的高通量测序方法，常用于定位调控元件如启动子、增强子等。T47D 是一种常用的乳腺癌细胞系，因此该数据集被归入肿瘤 / 乳腺癌分类，服务于乳腺癌相关基因组调控研究。数据集的作者标注为 ENCODE，DCC，来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。发布时间为 Feb 26 202。

【数据内容】

该数据集的文件数量为 1，文件样例为 GSE321046_series_matrix.txt.gz。主题标签包括“Genome binding/occupancy profiling by high throughput sequencing”、GPL18573 以及 9606。其中，GPL18573 为平台编号，9606 为人类物种分类编号。数据集内容围绕 T47D 细胞的 DNase-seq 测序结果展开，属于基因组结合/占据谱分析类型。除上述信息外，源站未提供更详细的样本数量、测序深度、基因组版本或数据表格字段说明。

【采集与来源】

数据来源于 NCBI，由 ENCODE 项目的数据协调中心提交。源站描述中仅提供了数据使用条款和条件的指引链接，指向 genome.gov 上的相关页面，包括 ENCODE 数据使用政策的外部用户条款。除来源站、作者和发布时间外，源站未提供具体的实验操作流程、细胞培养条件、测序平台详细参数或数据处理管线信息。

【适用场景】

该数据集适用于乳腺癌相关染色质开放性与调控元件研究，可用于分析 T47D 细胞中基因组结合/占据谱特征。由于属于高通量测序产生的基因组结合/占据谱数据，其典型用途包括识别开放染色质区域、辅助注释调控元件、以及与其他乳腺癌相关组学数据联合分析。具体适用场景需结合数据实际内容判断，源站未提供明确的推荐分析方向。

【使用方法】

使用该数据集时，可下载数据文件 GSE321046_series_matrix.txt.gz。该文件为 GZIP 压缩包格式，应按对应格式读取。建议先在小样本上核对字段与编码，确认无误后再批量接入。源站未提供额外的预处理步骤、软件工具或参数建议。

【质量与限制】

源站未提供关于数据质量指标、覆盖度、重复性、批次效应或技术偏差的具体说明。该数据集仅包含 1 个文件，文件样例为 GSE321046_series_matrix.txt.gz，源站未提供其他质控信息。使用时应参考源站描述中的数据使用条款与条件链接，并注意数据使用政策的相关要求。

【引用与许可】

该数据集由 ENCODE 项目 DCC 提交，来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。源站描述中明确提示，数据使用条款和条件请参考 http://www.genome.gov/27528022 以及 http://www.genome.gov/Pages/Research/ENCODE/ENCODE_Data_Use_Policy_for_External_Users_03-07-14.pdf。除上述指引外，源站未提供具体的引用格式、许可类型或授权细节。