ACSS2介导的代谢-表观遗传串扰驱动氟维司群耐药并作为新治疗靶点
该数据集来自NCBI GEO,聚焦ACSS2介导的代谢-表观遗传串扰在ER+乳腺癌氟维司群耐药中的作用。源站描述指出约70%乳腺癌表达ERα,30-40%的ER+患者出现复发转移,肝转移患者5年生存率仅31.9%

基本信息
资源简介
ACSS2介导的代谢-表观遗传串扰驱动氟维司群耐药并作为新治疗靶点
ACSS2-Mediated Metabolic-Epigenetic Crosstalk Drives Fulvestrant Resistance and Represents a Novel Therapeutic Target
该数据集来自NCBI GEO,聚焦ACSS2介导的代谢-表观遗传串扰在ER+乳腺癌氟维司群耐药中的作用。源站描述指出约70%乳腺癌表达ERα,30-40%的ER+患者出现复发转移,肝转移患者5年生存率仅31.9%。研究利用Carle Foundation Hospital队列验证氟维司群治疗肝转移患者预后不良,并在肝转移PDX模型中揭示脂质和乙酰辅酶A生成上调;此前工作显示氟维司群联合靶向ACSS2的乙酰辅酶A合成酶抑制剂可协同降低ER+转移性乳腺癌细胞活力。数据含1个文件,可用于表达谱分析与耐药机制研究(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Feb 18 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):内分泌治疗主要靶向激素依赖性癌细胞,主要通过雌激素受体α(ERα)发挥作用,约70%的乳腺癌表达ERα(ER+)。尽管治疗取得进展,30-40%的ER+乳腺癌患者仍出现复发和转移,5年生存率仅为31.9%。我们利用当地Carle Foundation Hospital队列验证了接受氟维司群(Fulv)治疗的肝转移患者预后不良,并在肝转移患者来源异种移植(PDX)模型中检查代谢通路,发现脂质和乙酰辅酶A生成上调。我们此前的工作表明,将Fulv与靶向酰基辅酶A合成酶短链家族成员2(ACSS2)的乙酰辅酶A合成酶抑制剂(ACSI)联合使用,可在体外协同降低ER+转移性乳腺癌(MBC)细胞活力。使用多种分析方法——同位素示踪、CUT&RUN测序、i
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL34284、9606。本站分类:肿瘤/乳腺癌。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE319879
【使用注意】
· 源站最后修改于 Oct 29 202,引用时请注意版本时效。
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pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
内分泌治疗主要针对激素依赖性癌细胞,主要通过雌激素受体α(ERα)发挥作用,约70%的乳腺癌表达ERα(ER+)。尽管治疗取得了进展,仍有30-40%的ER+乳腺癌患者出现复发和转移,5年生存率仅为31.9%。我们利用当地Carle Foundation Hospital队列验证了接受氟维司群(Fulv)治疗的肝转移患者预后不良,并在肝转移患者来源异种移植(PDX)模型中检测了代谢通路,发现脂质和乙酰辅酶A生成上调。我们此前的工作表明,将Fulv与靶向酰基辅酶A合成酶短链家族成员2(ACSS2)的乙酰辅酶A合成酶抑制剂(ACSI)联合使用,可在体外协同降低ER+转移性乳腺癌(MBC)细胞的活力。我们采用多种分析方法——同位素示踪、CUT&RUN测序、免疫荧光、蛋白质印迹和RNA测序——表征了乙酰辅酶A合成抑制对Fulv诱导变化的影响。Fulv处理MBC细胞可增加ACSS2表达和乙酸利用。
同位素示踪显示,Fulv减少了流向TCA循环的乙酸通量,同时促进了脂肪酸合成。重要的是,ACSS2主要定位于细胞核,CUT&RUN测序显示Fulv处理增加了ACSS2的染色质占据,并在与肿瘤进展相关基因附近出现了ERα/ACSS2/H3K27ac重叠位点,而ACSI与Fulv联合处理消除了这一现象。RNA测序显示,Fulv+ACSI联合处理减少了Fulv诱导的癌细胞代谢相关基因及癌症关键信号通路基因的表达。在治疗耐药的异种移植模型中,Fulv与ACSI联合处理减少了Fulv依赖性的转移负荷增加。我们的研究结果表明,ACSS2通过为表观遗传改变提供核内乙酰辅酶A,促进了内分泌治疗耐药。靶向这些癌细胞适应性改变代表了一种新的治
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。




