GSE316985：CRISPR筛选鉴定PRMT7为增强乳腺癌T细胞杀伤的治疗靶点

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源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE316985

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数据说明

全基因组关联研究（GWAS）已鉴定出超过220个与乳腺癌易感性相关的基因座，然而识别效应基因、其作用方式以及优先筛选治疗靶点仍是一项重大挑战。为解决这一问题，我们进行了混合CRISPR敲除和抑制筛选，以鉴定在共培养体系中影响细胞毒性T淋巴细胞（CTL）杀伤MCF7乳腺癌细胞的风险基因座基因。这些筛选揭示了33个候选调节基因，其中我们在两种细胞系中通过单基因编辑验证了六个。IRF1、ATF7IP和CASP8的缺失赋予了对CTL杀伤的抗性，而CFLAR、CREBBP和PRMT7的破坏则增强了敏感性。临床数据分析显示，PRMT7表达与乳腺癌患者队列中CD8+浸润和生存呈负相关。PRMT7的药理学抑制使乳腺细胞在体外对CTL杀伤敏感，且Prmt7缺陷肿瘤在免疫健全小鼠中表现出生长减缓及CD8+ T细胞浸润增加。在免疫缺陷小鼠中未观察到Prmt7依赖性肿瘤生长的增强，表明Prmt7参与免疫逃逸。

本研究强调了CRISPR筛选在高通量功能验证GWAS发现中的实用性，并确定抑制PRMT7是一种有前景的治疗策略。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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