GSE309120：早期与晚期播散肿瘤细胞在肺转移进展中的作用研究

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源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE309120

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数据说明

该领域近期的开创性工作不仅描述了转移微环境中早期肿瘤来源癌细胞的存在，还阐明了若干导致其播散的潜在机制。然而，早期癌细胞一旦播散后如何与其新的细胞环境相互作用，目前仍不清楚。在本研究中，我们旨在填补关于免疫微环境如何响应并影响早期与晚期到达的播散性肿瘤细胞（DTC）种子命运这一知识空白。为了区分早期与晚期播散的癌细胞，我们首先构建了带条形码的癌细胞系，然后在三阴性乳腺癌（TNBC）肺转移背景下进行了多次交错注射。我们的初步数据显示，尽管早期时间点注射的癌细胞与晚期到达的癌细胞相比并不具有遗传和转录组学优势，但其优先增殖。

此外，对从肺转移灶中提取的带条形码的癌细胞和免疫细胞进行单细胞RNA测序分析，揭示了一个抗炎性肿瘤相关巨噬细胞（TAM）集群，该集群高表达巨噬细胞触发受体2（Trem2）程序基因和补体成分q（C1q）。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。