双锥形高聚集倾向草酸钙晶体直接附着乳腺癌细胞并影响其表型

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE308114

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数据说明

多种类型的晶体可在正常和病理条件下于我们体内形成，其中危害较大的晶体已被深入研究。然而，人们对二水草酸钙（COD）晶体了解要少得多，这类晶体通常与良性病变相关。一般而言，草酸钙是病理性生物矿物，见于肾结石以及乳腺癌和甲状腺癌中的微钙化（MCs）。在乳腺癌微钙化（MCs）中，COD晶体仅与良性病变相关，而我们最近表明，它们在体外可抑制乳腺癌前病变进展。在此，我们研究了具有不同形态和性质的合成草酸钙晶体——包括COD和一水草酸钙（COM）——对晶体-细胞相互作用的影响。我们发现，负电荷较少的晶体表现出更强的聚集倾向，并且作为聚集体，它们更好地附着于细胞，尤其是侵袭性乳腺癌细胞系的细胞。我们未发现晶体的结晶度、表面积和溶解度与细胞附着之间存在任何关联。

那些确实能高效附着到细胞上的晶体类型，即具有薄或厚双锥体形态的COD，对细胞表型影响最大，并在功能上延迟了细胞生长，这很可能通过接触抑制实现。值得注意的是，在形态和大小方面，这些晶体类似于在良性乳腺组织中发现的COD MCs，提示它们参与了一种肿瘤抑制机制。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。