GSE307964:MiR-342 对 E2F 信号网络的抑制限制三阴性乳腺癌转移性生长 [RNA-Seq]

该RNA-Seq数据集含1个文件。研究显示,miR-342为TNBC转移抑制因子;其异位表达在小鼠模型中抑制转移,限制播散肿瘤细胞生长

geo
浏览 19
时间序列分类GPL185739606
GSE307964: MiR-342 suppression of an E2F signaling network limits metastatic outgrowth of triple negative breast cancer [RNA-Seq]

基本信息

模态
时间序列
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-11-03

资源简介

GSE307964:MiR-342 对 E2F 信号网络的抑制限制三阴性乳腺癌转移性生长 [RNA-Seq]

MiR-342 suppression of an E2F signaling network limits metastatic outgrowth of triple negative breast cancer [RNA-Seq]

该RNA-Seq数据集含1个文件。研究显示,miR-342为TNBC转移抑制因子;其异位表达在小鼠模型中抑制转移,限制播散肿瘤细胞生长。miR-342靶向E2F1及下游E2F靶基因,抑制E2F信号;CDK4/6抑制剂palbociclib可减少TNBC转移生长。这提示存在受miR-342下调的促转移E2F通路,并提示CDK4/6抑制剂对低表达miR-342肿瘤患者的临床效用(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Sep 12 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):三阴性乳腺癌(TNBC)患者中转移发生频率高,其病因仍知之甚少。通过对转移性TNBC小鼠模型和患者数据集的整合分析,我们将miR-342鉴定为TNBC转移的临床相关抑制因子。miR-342的异位表达足以在免疫健全小鼠模型和异种移植小鼠模型中抑制TNBC转移,特别是限制播散性肿瘤细胞的生长。使用多组学方法,包括Argonaute-HITS-CLIP,我们鉴定了TNBC中miR-342靶标的总体集合。通过靶向E2F1和许多下游E2F靶基因,miR-342协调转录和转录后调控网络,共同抑制TNBC中的E2F信号传导。与此一致,使用CDK4/6抑制剂palbociclib抑制E2F通路可减少TNBC的转移性生长。这些发现证明存在一种促转移E2F通路,其被miR-342下调,并提示CDK4/6抑制剂在肿瘤表达低水平miR-342的患者中限制TNBC转移的临床实用性。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL18573、9606。本站分类:肿瘤/乳腺癌。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE307964

【使用注意】

· 源站最后修改于 Jul 17 202,引用时请注意版本时效。

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付,我们提供全链路闭环服务,让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持?联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

免费样本无法满足模型训练要求?千方提供经三甲医院脱敏、带病理回证与专家标注的商业级专病数据集。

使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE307964

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

三阴性乳腺癌(TNBC)患者中转移发生频率高,其病因仍知之甚少。通过对转移性TNBC小鼠模型和患者数据集的整合分析,我们将miR-342鉴定为TNBC转移的临床相关抑制因子。miR-342的异位表达足以在免疫健全小鼠模型和异种移植小鼠模型中抑制TNBC转移,特别是限制播散性肿瘤细胞的生长。使用多组学方法,包括Argonaute-HITS-CLIP,我们鉴定了TNBC中miR-342靶标的总体集合。通过靶向E2F1和许多下游E2F靶基因,miR-342协调转录和转录后调控网络,共同抑制TNBC中的E2F信号传导。与此一致,使用CDK4/6抑制剂palbociclib抑制E2F通路可减少TNBC的转移性生长。这些发现证明存在一种促转移E2F通路,其被miR-342下调,并提示CDK4/6抑制剂在肿瘤表达低水平miR-342的患者中限制TNBC转移的临床实用性。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?

公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。