PCBP1结合单链poly-cytosine基序增强cGAS感知并抑制乳腺癌发展 [snRNA-Seq]

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE307750

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

cGAS-STING通路通过核酸感知和I型干扰素产生在控制肿瘤进展中发挥核心作用。在此，我们鉴定出Poly(rC)结合蛋白1（PCBP1）是一种在乳腺癌中放大cGAS-STING信号传导的肿瘤抑制因子。利用患者数据集和乳腺上皮细胞条件性PCBP1敲除的转基因小鼠模型，我们表明PCBP1表达与生存改善、肿瘤负荷降低、I型IFN和ISG表达增加以及细胞毒性T细胞浸润升高相关。在机制上，PCBP1通过其KH结构域结合富含胞嘧啶的单链基序，并增加cGAS对这些核酸的亲和力。破坏保守的GXXG基序会损害PCBP1的核酸结合和cGAS激活。尽管cGAS是一种双链DNA传感器，本身没有内在序列特异性，但我们发现单链核酸结合蛋白PCBP1通过参与序列特异性基序增强cGAS感知，作为一种重要的核酸共传感器损害肿瘤发生。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。