Largazole 通过 miR-125b-5p 靶向 Musashi 蛋白表达并使三阴性乳腺癌细胞对放疗敏感

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE305290

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数据说明

背景：近期研究结果提示，组蛋白去乙酰化酶（HDAC）抑制剂largazole是Musashi RNA结合蛋白功能的抑制剂。在此，我们评估这种相互作用，并评价largazole与三阴性乳腺癌（TNBC）进展及放疗抵抗的相关性。方法：用largazole处理原代患者来源的TNBC细胞和细胞系，并通过MTT实验、数字全息显微镜和流式细胞术分析细胞活力、增殖、运动能力、细胞周期、DNA合成及修复以及干性。为阐明largazole处理与Musashi表达之间的联系，在largazole处理后检测miR-125b-5p，并在野生型细胞中过表达miR-125b-5p，以确定其对Musashi水平的影响。靶向mRNA和蛋白表达分析辅以largazole处理后的RNA测序数据。最后，使用γ-H2AX和克隆形成实验对DNA双链断裂和辐射后存活进行定量。结果：largazole在TNBC中表现出细胞毒性作用，但在非恶性细胞培养物中未表现出细胞毒性作用。

Largazole处理强烈抑制增殖、DNA合成和细胞运动，并诱导细胞周期停滞。Largazole处理后，Musashi蛋白水平通过上调miR-125b-5p而下调。蛋白表达和RNA测序分析表明，癌症干性、细胞周期进程和DNA修复相关信号通路缺失。因此，在largazole处理的样本中，放疗诱导的DNA双链断裂增加，而放射后细胞存活减少。结论：HDAC抑制剂largazole损害肿瘤生长和运动，并在TNBC中通过miR-125b-5p下调Musashi蛋白。此外，largazole通过减弱DNA修复而充当放射增敏剂，从而支持其治疗疗效。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。