GSE301773：GATA3通过抑制整合素β1信号促进铁死亡抵抗

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源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE301773

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数据说明

理解决定细胞对铁死亡应激反应的机制是一个紧迫的问题，对生物学和病理学具有重大意义。我们在乳腺癌的背景下研究了这些机制，其中肿瘤由对铁死亡敏感性不同的多种癌细胞群体组成。通过单细胞RNA测序，我们确定具有管腔分化的癌细胞群体比异质性肿瘤内的其他细胞更耐受铁死亡。随后的生物信息学分析和实验揭示，促进管腔分化的转录因子GATA3在管腔乳腺癌细胞的铁死亡抵抗中起因果作用。在探究所涉及的机制过程中，我们发现GATA3抑制整合素β1及其下游信号级联的表达。这一观察使我们证明，整合素β1信号对于基底乳腺癌细胞对铁死亡的敏感性是必要的，因为它调节FAK/ROCK通路，该通路维持ACSL4的表达，而ACSL4是一种对铁死亡至关重要的脂质修饰酶。

GATA3对整合素β1的抑制阻断了该信号通路，使细胞对铁死亡产生抵抗。综合这些数据，我们得以深入了解与乳腺肿瘤中多种类型细胞的细胞生物学和信号通路相关的铁死亡敏感性和耐药性机制。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。