烟碱型乙酰胆碱受体靶向阻断乳腺癌小鼠模型肿瘤进展的遗传与药理学研究

该数据集来自 NCBI GEO(GSE299680),包含小鼠乳腺癌模型中骨髓来源巨噬细胞和树突状细胞(BMDMs/BMDCs)的单细胞 RNA 测序数据,用于评估 CHRNA7 敲除对体内免疫细胞转录谱的影响

geo
浏览 4
基因组分类GPL2424710090
GSE299680: Genetic and pharmacological targeting of nicotinic acetylcholine receptor action blocks tumor progression in mouse models of breast cancer

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-23

资源简介

烟碱型乙酰胆碱受体靶向阻断乳腺癌小鼠模型肿瘤进展的遗传与药理学研究

Genetic and pharmacological targeting of nicotinic acetylcholine receptor action blocks tumor progression in mouse models of breast cancer

该数据集来自 NCBI GEO(GSE299680),包含小鼠乳腺癌模型中骨髓来源巨噬细胞和树突状细胞(BMDMs/BMDCs)的单细胞 RNA 测序数据,用于评估 CHRNA7 敲除对体内免疫细胞转录谱的影响。数据覆盖野生型与 CHRNA7 敲除细胞的表达谱比较,可用于研究 α7 烟碱型乙酰胆碱受体在肿瘤相关髓系免疫细胞中的功能及炎症相关转录程序变化(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Jun 12 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):α7 烟碱型乙酰胆碱受体在损伤和感染模型中已在髓系免疫细胞中具有功能作用,但其在肿瘤相关免疫细胞中的作用尚未确立。在此,我们聚焦于 CHRNA7 在免疫健全的三阴性乳腺癌小鼠模型髓系免疫细胞中的作用。我们 scRNAseq 研究的目的是评估 CHRNA7 缺失对体内免疫细胞转录谱的影响。我们建立了经 M-CSF 和 IL-4 分化后的骨髓来源髓系细胞原代培养物,其产生巨噬细胞和树突状细胞的混合物(BMDMs/BMDCs)。骨髓来源巨噬细胞和树突状细胞(BMDMs/BMDCs)的单细胞 RNA 测序显示,与野生型(WT)相比,CHRNA7 敲除(KO)细胞表现出不同的转录谱,包括炎症和白细胞表达的降低

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL24247、10090。本站分类:肿瘤/乳腺癌。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE299680

【使用注意】

· 源站最后修改于 Jun 17 202,引用时请注意版本时效。

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付,我们提供全链路闭环服务,让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持?联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

有偿下载

公开数据集受托下载与技术交付服务。

提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)

暂未开放

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE299680

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

α7烟碱型乙酰胆碱受体在损伤和感染模型的髓系免疫细胞中具有功能作用,但其在肿瘤相关免疫细胞中的作用尚未明确。本文聚焦于CHRNA7在免疫健全的三阴性乳腺癌小鼠模型髓系免疫细胞中的作用。我们单细胞RNA测序研究的目的是评估CHRNA7缺失对体内免疫细胞转录谱的影响。我们经M-CSF和IL-4诱导分化建立了骨髓来源髓系细胞的原代培养,该培养体系可产生巨噬细胞与树突状细胞的混合群体(BMDMs/BMDCs)。对骨髓来源巨噬细胞和树突状细胞(BMDMs/BMDCs)的单细胞RNA测序显示,与野生型(WT)相比,CHRNA7敲除(KO)细胞呈现不同的转录谱,包括炎症和白细胞迁移通路表达降低,应激和凋亡信号基因表达升高。CHRNA7 KO细胞上调缺氧和泛素化相关基因,而CHRNA7 WT细胞表达更高水平的TNFα信号和免疫功能标志物。

这些结果支持CHRNA7在调节免疫基因表达中发挥细胞内在作用。基于这些结果,我们进一步开展了体内研究,以评估特异性CHRNA7激动剂AR-R17779对免疫细胞活化、肿瘤负荷及转移的影响。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

数据缺失?

依托陕西、四川两大基地,我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系,覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程,为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。

⚡️ 需要数据支持或标注服务?立即联系我们获取专业方案。

获取专属数据定制方案