三阴性乳腺癌类器官单细胞基因表达谱
该数据集为三阴性乳腺癌（TNBC）类器官的单细胞基因表达谱数据，来源于 NCBI，包含 1 个文件（GSE299267_series_matrix.txt.gz）
基本信息
资源简介
三阴性乳腺癌类器官单细胞基因表达谱
Single cell gene expression profiling of triple negative breast cancer organoids
该数据集为三阴性乳腺癌（TNBC）类器官的单细胞基因表达谱数据，来源于 NCBI，包含 1 个文件（GSE299267_series_matrix.txt.gz）。TNBC 是一种异质性疾病，由受体酪氨酸激酶异常激活及增殖性 MEK-ERK 信号通路驱动。研究利用两种 TNBC 类器官系中激酶表达水平的异质性，结合人类 Ser/Thr 激酶组底物特异性图谱，预测两种类器官系的表型差异，并通过单核 RNAseq 验证，发现肿瘤细胞亚群中免疫和炎症特征高度富集。数据可用于 TNBC 异质性、激酶信号通路及肿瘤细胞亚群相关研究（来源 NCBI）。
【数据集背景】
源站首次发布：Jun 09 202。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：三阴性乳腺癌（TNBC）是一种异质性疾病，由受体酪氨酸激酶异常激活和增殖性 MEK-ERK 信号通路驱动。利用两种 TNBC 类器官系中激酶表达水平的异质性，结合人类 Ser/Thr 激酶组底物特异性图谱，预测了两种类器官系之间的表型差异。单核 RNAseq 验证了这些预测，显示肿瘤细胞亚群中免疫和炎症特征高度富集。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个，合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签：GPL30173、9606。本站分类：肿瘤/乳腺癌。
【获取与许可】
源站页面：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE299267
【使用注意】
· 源站最后修改于 Jun 06 202，引用时请注意版本时效。
下载信息
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pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
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- OpenDataLab:
数据说明
三阴性乳腺癌（TNBC）是一种异质性疾病，由受体酪氨酸激酶的异常激活以及增殖性MEK-ERK信号通路驱动。利用两种TNBC类器官系之间激酶表达水平的异质性，并结合人类Ser/Thr激酶组底物特异性图谱（Atlas of substrate specificities for the human Ser/Thr kinome），可预测这两种类器官系之间的表型差异。单核RNA测序验证了这些预测，显示肿瘤细胞的一个亚群中免疫和炎症特征高度富集。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册（NMPA/FDA）？
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连，提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。
