GSE299101：DICER1失调触发miRNA重编程、促进间充质细胞命运并减缓TNBC致瘤表型

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE299101

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

DICER1是生成成熟且具有活性的miRNA所必需的关键加工酶。降低DICER1功能的突变会导致miRNA水平发生广泛变化，进而引起转录组和细胞表型的改变。此前，我们发现Dicer1 mRNA 3‘UTR区域的突变会大幅降低DICER1蛋白水平和miRNA的生成。携带这些突变的三阴性乳腺癌细胞生长和迁移速度较慢，致瘤潜能也降低。通过比较这些细胞的转录组和miRNA谱，我们发现miR30d-5p在DICER1突变细胞中显著减少。miR30d-5p的减少导致其靶标SNAIL的mRNA稳定性增加、蛋白水平升高。SNAIL是一种转录因子，可促进间充质细胞命运所需基因的转录。我们证明，SNAIL蛋白水平升高会驱动这些细胞发生上皮-间充质转化，而添加miR30d-5p可部分逆转这一过程。我们的结果凸显了DICER1和miRNA水平在调节乳腺癌细胞命运中的重要作用。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。