GSE298876：LMO2调控乳腺上皮细胞上皮-间质可塑性

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源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE298876

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数据说明

乳腺上皮细胞的细胞可塑性使其能够发生动态的细胞状态变化，这对于正常发育至关重要，但可被乳腺癌细胞劫持以驱动肿瘤进展。然而，通过调控杂交细胞状态（上皮/间质）来维持细胞可塑性的分子因素尚未完全明确。由于LMO2此前已被证明可调控转移，本研究确定了LMO2在正常乳腺上皮细胞中的作用。利用谱系追踪和基因敲除小鼠模型，我们发现Lmo2谱系追踪细胞长期存在于乳腺中，既存在于腔层也存在于基底层的，但增殖潜力有限。Lmo2缺失不影响乳腺发育，但急性缺失会降低体内重建能力。此外，在小鼠和人乳腺上皮细胞（MECs）中敲低LMO2会减少类器官形成。我们发现LMO2维持杂交细胞状态，而LMO2敲低促进间质分化。

LMO2敲低细胞的转录谱分析显示，上皮-间质转化（EMT）通路显著富集，并且MCAM表达上调，MCAM是乳腺再生能力的负调控因子。综上所述，我们的研究表明LMO2在维持正常乳腺上皮细胞的细胞可塑性中发挥作用，这为癌细胞劫持正常分化程序以驱动肿瘤进展提供了新的见解。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。